過硼酸鈉較具鹼性，在腸道中與酸作用，可分解為硼酸鹽（如NaBO2）、硼酸與過氧化物（如過氧化氫）。至於硼酸鹽對人體的毒性並不高，但在大量暴露時，可對人體延髓areapostrema造成刺激，而引起自發性嘔吐。另外，硼酸鹽在單次大量或重覆暴露時，可對中樞神經係統與腎潘產生毒性，並可能引起維他命B2（riboflavin）缺乏。
硼酸鹽中毒，通常為皮膚、傷口或口服，多次或長期暴露後才會引起症狀。一般硼酸鹽中毒可能致死之最低劑量，嬰兒為2-3g，兒童為5-6g，成人為15-20g。臨床表現方麵，在腸胃道可能有黏膜變紅、嘔吐、腹瀉、嘔吐物及糞便呈藍綠色或腸胃道出血等症狀，並可因脫水導致低血壓、心律不整、發紺及休克；腎潘方麵則可產生寡尿或無尿、近端腎小管壞死、腎潘衰竭、代謝性酸血症等。至於中樞神經係統可導致頭痛、步態不穩、感覺異常、躁動不安、虛弱、體溫異常、手抖、抽搐、甚至於死亡。皮膚可產生手掌、腳掌及臀部產生脫皮及紅疹現象，就有如熟的龍蝦一般（boiledlobstersyndrome）；並可在口腔及肛門周圍，或其他黏膜也引起類似的脫皮症狀，及全身性的紅疹。此種皮膚的症狀為全身性症狀，因此並非僅有皮膚暴露才會產生。如維他命B2缺乏，則可導致喉痛、咽部紅腫、口角炎、舌炎、脂漏性皮膚炎或貧血等病症。
硼酸中毒的症狀：開始為頭痛，頭暈，惡心，嘔吐，腹部絞痛，腹瀉，嘔吐物及糞便常帶血液，或呈藍綠色；隨即出現大片紅色皮疹，1～2日後脫皮，偶發生剝脫性皮炎，粘膜也可有充血和剝脫現象；皮疹可以波及咽部及鼓膜，部分病人出現肝脂肪變性，黃疸以及腎髒損害，重症病兒常有感覺異常，視力障礙，共濟失調，震顫，精神錯亂，驚厥，譫妄，角弓反張，青紫和昏迷，體溫，血壓下降，病兒可於24小時至數日內因休克，尿毒症等而死亡，有些中毒嬰兒在昏迷之前，僅有發熱或體溫下降的征象。
因硼酸鹽會使維他命B2缺乏，且維他命B2可與硼酸鹽形成水溶性複合物，減少其細胞毒性，並協助排除，因此在治療方麵，應靜脈或肌肉注射補充維他命B21mg/Kg至於皮膚、眼睛或吸入暴露的處理，因硼酸鹽刺激性很低，通常僅以水衝洗乾淨或將患者移至空氣新鮮處即可但對於皮膚多次或大量暴露者，仍應小心產生全身性中毒的可能
對於硼酸或硼酸鹽中毒的病患，應監測電解質，腎臟功能，動脈血液氣體分析及心電圖等，另外可以測定血中硼酸鹽的濃度，有助於臨床上的診斷。
硼酸中毒除了常規的治療外，飲食需注意：宜營養豐富、容易消化、清淡的食物，多吃水果、蔬菜，多飲水。忌辛辣食物。忌油膩厚味。
口服硼酸中毒時，立即催吐並選用2％～5％碳酸氫鈉溶液(硼砂中毒勿用)、生理鹽水或微溫清水等洗胃。洗胃後灌入硫酸鈉導瀉，其他部位沾染的硼酸亦需用生理鹽水、清水或肥皂水等洗淨。靜脈滴注葡萄糖鹽水和血漿對治療休克及加速毒物排泄均有助益。亦可靜滴生理鹽水。如有酸中毒，應用適量乳酸鈉或碳酸氫鈉溶液，糾正脫水、酸中毒後，持續靜脈滴注5％～10％葡萄糖和含鈉溶液，維持尿呈堿性，以利硼酸排出。嚴重病人可考慮換血、血液透析或腹膜透析等療法。其他為對症治療。
硼砂中毒的治療和硼酸類似，但洗胃不用堿性溶液。對驚厥除應用鎮靜劑外，並可酌用10％葡萄糖酸鈣10～20ml，加入葡萄糖液20～40ml內緩慢靜注。