細菌性腦膜炎本身的危害都是比較嚴重的，而這種疾病一直得不到有效的治療控製，那麼還可能會引起其他的並發症，比如導致經常性的頭痛，難以集中注意力或者是免疫力低下以及短期記憶喪失等危害。
1、盡管很多腦膜炎患者能夠在短時間內徹底恢複，但是腦膜炎尤其是細菌性腦膜炎，可導致多種後遺症。其中有些後遺症會帶來永久性的身體殘疾，而有些則沒有這麼明顯，它們會影響病人的情緒。根據英國的全國腦膜炎組織，幼兒患腦膜炎後所得的並發症是比較輕微的。
2、幼兒的並發症包括行為幼稚，發脾氣，忘記最近學到的技能，尿床和失眠。年齡較大的兒童和成年人的腦膜炎並發症有以下方麵：嗜睡、經常性頭痛、難以集中精力、短期記憶喪失、笨拙、平衡問題、抑鬱症、免疫力低下、情緒不穩定和學習困難。
3、聾。醫學專家提醒腦膜炎患者要做聽力測試。尤其是那些不易察覺失聰的幼兒，聽力測試是特別重要的。
4、其它嚴重的並發症包括腦損傷、癲癇、視力變化。行為困難，如暴躁發脾氣、具有攻擊性行為以及情緒波動等，這些都可能成為長期性問題。
