抗甲狀腺過氧化物酶抗體高說明可能存在類風濕關節炎、自身免疫性甲狀腺疾病、其他自身免疫性疾病等，需要根據病因針對治療。
1、類風濕關節炎：體內激素水平發生變化、感染細菌病毒、遺傳因素影響等原因都可能會引起類風濕關節炎，引起抗甲狀腺過氧化物酶抗體高，一般可以遵醫囑服用左甲狀腺素鈉片、硒酵母片，並遵醫囑配合雙氯芬酸鈉緩釋片等藥物，達到治療的效果。
2、自身免疫性甲狀腺疾病：橋本甲狀腺炎、Graves病、甲亢等甲狀腺疾病，容易導致甲狀腺組織免疫損傷，引起抗甲狀腺過氧化物酶抗體升高，需要及時到正規醫院做甲狀腺彩超、甲狀腺功能檢查明確診斷，在醫生的指導下針對性治療。
3、其他自身免疫性疾病：當患有係統性紅斑狼瘡時，也可能會引起甲狀腺過氧化物酶抗體過高，需要及時到正規醫院內分泌科就診。
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