有數種病毒可引起手足口病。最常見的是柯薩奇病毒A16型，此外柯薩奇病毒 A的其他株或腸道病毒71型也可引起手足口病。柯薩奇病毒是腸道病毒的一種。腸道病毒包括脊髓灰質炎病毒、柯薩奇病毒和埃可病毒。
其感染部位是包括口腔在內的整個消化道，通過汙染的食物、飲料、水果等經口進入體內，並在腸道增殖。
手足口病主要發生在4歲以下的兒童，但成人也有可能得病，因此可以說每個人都是易感的。感染後隻獲得該型別病毒的免疫力，對其它型別病毒再感染無交叉免疫，即患手足口病後還可能因感染其它型別病毒而再次患手足口病。
手足口病EV71病毒可以侵害神經係統，造成一係列的重症表現。出現神經性病毒反應。若患者體質較弱，可能導致呼吸循環係統衰竭。可能會發展得很快。剛開始的時候可以沒什麼反應，過兩個小時以後很快識別，口吐粉紅色唾液，說明已經水腫了。對兒童危害很大，容易造成呼吸循環係統衰竭。
手足口病表現在皮膚和口腔上，但病毒會侵犯心、腦、腎等重要器官。要加強對患者的臨床監測，如出現高熱、白細胞不明原因增高而查不出其他感染灶時，就要警惕暴發性心肌炎的發生。伴發無菌性腦膜炎時，其症狀表現為發燒、頭痛、頸部僵硬、嘔吐、易煩燥、睡眠不安穩等;身體偶而可發現非特異性紅丘疹，甚至點狀出血點。合並有中樞神經係統症狀的人，以2歲以內患兒多見。
極少病人可並發無菌性或病毒性腦膜炎，其症狀是發熱、頭痛、頸直或背痛。其他常見的並發症還有：腦炎或腦膜炎、肺炎、肺水腫、馳張性麻痹、脊髓灰質炎樣肢體癱瘓、過敏性紫癜等，多發生於發病後2-5 天。但以無菌性腦炎、心肌炎等最為常見。
手足口病是一種腸道病毒病，潛伏期一般3-7天，沒有明顯的前驅症狀：多數病人突然起病。主要侵犯手、足、口、臀四個部位；臨床上更有不痛、不癢、不結痂、不結疤的四不特征。由於口腔潰瘍疼痛，患兒流涎拒食。口腔粘膜疹出現比較早，起初為粟米樣斑丘疹或水皰，周圍有紅暈，主要位於舌及兩頰部，唇齒側也常發生。手、足等遠端部位出現或平或凸的班丘疹或皰疹，皮疹不癢，斑丘疹在5天左右由紅變暗，然後消退；皰疹呈圓形或橢圓形扁平凸起，內有混濁液體，長徑與皮紋走向一致，如黃豆大小不等，一般無疼痛及癢感，愈合後不留痕跡。手、足、口病損在同一患者不一定全部出現。水泡及皮疹通常會在一周內消退。
1.一般症狀表現：
1)急性起病，潛伏期3～5天，有低熱、全身不適、腹痛等前驅症。口腔粘膜出現散在疼痛性粟粒至綠豆大小水皰，手、足出現斑丘疹、皰疹，初起為斑丘疹，後轉變為皰疹，圓形或橢圓形，約3-7mm如米粒大小，較水痘皮疹為小，質地較硬，周圍有紅暈，皰內液體較少，在灰白色的膜下可以見到點狀或片狀的糜爛麵。皮疹消退後不留瘢痕或色素沉著，如有繼發感染常使皮膚損害加重。
2)除手足口外，亦可見於臀部及肛門附近，偶可見於軀幹及四肢，數天後幹涸、消退，皮疹無瘙癢，無疼痛感。
3)個別兒童可出現泛發性丘疹、水皰，伴發無菌性腦膜炎、腦炎、心肌炎等。可伴有咳嗽、流涕、食欲不振、惡心、嘔吐、頭痛等症狀。
2.重症病例表現：
少數病例(尤其是小於3歲者)可出現腦炎、腦脊髓炎、腦膜炎、肺水腫、循環衰竭等。
1)呼吸係統表現為：呼吸淺促、困難，呼吸節律改變，口唇紫紺，口吐白色、粉紅色或血性泡沫液(痰)，肺部可聞及痰鳴音或濕羅音;
2)神經係統表現為：精神差、嗜睡、頭痛、嘔吐、易驚、肢體抖動、無力或癱瘓;查體可見腦膜刺激症、腱反射減弱或消失;危重病例可表現為頻繁抽搐、昏迷、腦水腫、腦疝;
3)循環係統表現為：麵色蒼白，心率增快或緩慢，脈搏淺速、減弱甚至消失，四肢發涼，指(趾)發紺，血壓升高或下降。
在預防方麵，應注意在夏季此病流行時，盡可能少帶孩子到公共場所，平日教育小兒要養成良好的衛生習慣，做到飯前、便後洗手；對玩具、餐具要定期消毒做到早發現、早治療、早隔離若此病在托兒所或幼兒園內流行時，首先應將患兒與健康兒童隔離，將玩具用消毒液消毒，也可以給健康個孩子口服板藍根顆粒預防
可將金銀花、茵陳、生薏仁、大青葉（即板藍根的葉子）、甘草等放入水中，煮開後20分鍾倒出，當茶飲用三五天即可，但體虛、容易拉肚子的孩子不要喝
對於口裏長皰疹、有潰瘍、口氣臭的孩子，除了上述方子之外，還可用燈心花、藿香、生石膏、防風、淡竹葉煎水飲用，可清心火對於食欲不振的孩子還可在燈心花方子裏增加麥芽，以開胃
如果孩子手足出現皰疹，則可采用外洗法，用野菊花、紫草、地膚子、苦參等煮沸，冷卻至適中溫度時浸泡手足，以起到清熱、化濕、涼血的作用
手足口病的檢查主要包括血常規、血生化檢查、血氣分析、腦脊液檢查、病原學檢查、血清學檢查這幾項，由於病毒檢測需要2-4周才能出結果，所以病人當天是不能確診病例的。
（一）血常規
白細胞計數正常或降低，病情危重者白細胞計數可明顯升高。
（二）血生化檢查
部分病例可有輕度穀丙轉氨酶（ALT）、穀草轉氨酶（AST）、肌酸激酶同工酶（CK-MB）升高，病情危重者可有肌鈣蛋白（cTnI）、血糖升高。C反應蛋白（CRP）一般不升高。乳酸水平升高。
（三）血氣分析
呼吸係統受累時可有動脈血氧分壓降低、血氧飽和度下降，二氧化碳分壓升高，酸中毒。
（四）腦脊液檢查
神經係統受累時可表現為：外觀清亮，壓力增高，白細胞計數增多，多以單核細胞為主，蛋白正常或輕度增多，糖和氯化物正常。
（五）病原學檢查
CoxA16 、EV71等腸道病毒特異性核酸陽性或分離到腸道病毒。咽、氣道分泌物、皰疹液、糞便陽性率較高。
（六）血清學檢查
急性期與恢複期血清CoxA16、EV71等腸道病毒中和抗體有4倍以上的升高。
手足口病四季均可發病，以夏秋季多見，如果在夏季得病，兒童容易引起脫水和電解質紊亂，需要適當補水和營養。患兒因發熱、口腔皰疹，胃口較差，不願進食，所以宜給患兒吃清淡、溫性、可口、易消化、柔軟的流質或半流質，禁食冰冷、辛辣、鹹等刺激性食物。
手足口病吃哪些食物對身體好：
第一階段：病初。嘴疼、畏食。飲食要點：以牛奶、豆漿、米湯、蛋花湯等流質食物為主，少食多餐，維持基本的營養需要。為了進食時減少嘴疼，食物要不燙、不涼，味道要不鹹、不酸。這裏介紹一個小竅門-用吸管吸食，減少食物與口腔粘膜的接觸。
第二階段：燒退。嘴疼減輕。飲食以泥糊狀食物為主。舉例：牛奶香蕉糊。牛奶提供優質蛋白質;香蕉易製成糊狀，富含碳水化合物、胡蘿卜素和果膠，能提供熱能、維生素，且潤腸通便。
第三階段:恢複期。飲食要多餐。量不需太多，營養要高。如雞蛋羹中加入少量菜末、碎豆腐、碎蘑菇等。大約十天左右恢複正常飲食。也有說法“全素，不動葷腥”。完全吃素，把牛奶、雞蛋等營養品排除在外，營養質量不夠，缺少優質蛋白質，而抗體是一種蛋白質，故全素不妥。
手足口病最好不要吃哪些食物：
1、禁食冰冷、辛辣、酸鹹等刺激性食物。
2、治療期間應注意不吃魚、蝦、蟹。
特別是在夏天，天氣炎熱，大家都會選擇冰冷的食物，這會影響手足口病患者的腸胃健康，導致本來就沒有什麼食欲的患者更加吃不下東西，不利於病情的恢複。
而辛辣的食物更是不要多吃，因為辛辣食物屬熱性，吃了很容易上火，手足口病患者會出現口腔潰瘍的症狀，吃辛辣的食物會加重病情，所以辛辣食物不能吃。
一、手足口病西醫治療方法
1、治療原則主要是對症處理：
(1)口服B族維生素，如維生素B1、維生素B2、維生素C；
(2)嘔吐難以進食者給予輸液。當口腔因有糜爛吃東西困難時，可以給予易消化的流食，飯後漱口。
(3)口腔潰瘍給予青梅散、金黴素魚肝油或錫類散外塗，疼痛劇烈塗以利多卡因或苯佐卡因加硼砂甘油，促使糜爛麵早日愈合。並保持局部清潔，避免細菌的繼發感染。
(4)皮膚皰疹有繼發感染者塗以1％甲紫；
(5)服用抗病毒的藥物，如病毒唑、病毒靈等。若伴有發熱時，可以用一些清熱解毒的中藥。
2、手足口病可能結合心肌炎、腦炎、腦膜炎等病症，應及時進行治療。
(1)並發腦膜炎者按照腦膜炎治療
(2)並發心肌炎者按照心肌炎治療。
二、手足口病中醫治療方法
1、中藥方劑：
(1)雙花防毒飲方劑：金銀花10g，野菊花10g，蚤休15g，茯苓10g，甘草3g。製法：上藥加水300ml，浸泡30分鍾，以武火(大火)煎煮沸騰，改用文火(小火)煎煮15分鍾，煎成藥液150ml。每日1劑，藥液分2～3次服，連續服用7～10天。3歲以下嬰幼兒可減量服用。
(2)對急性期出現低熱或無發熱，流涕咳嗽，咽紅疼痛，或納差惡心，可用“銀翹散”方劑；
(3)高熱持續，口腔、手足、臀部、四肢皰疹分布稠密，可用“清瘟敗毒飲”方劑；對出現高熱不退，頻咳氣急等並發症，可用“己椒藶黃丸合參附湯”方劑。
(4)治療口疼牙齦腫：可用板藍根10克，黃芩、白蘚皮各6克，雙花3克，竹葉、薄荷各2克，煎水含漱。
(5)在疾病康複期，對於口幹咽痛的孩子可在沙參麥冬湯方劑裏，加生地黃、蘆根養陰生津，清熱潤咽。
2、中成藥
(1)玉屏風口服液合板藍根衝劑，連續服用7～10天。
(2)治療口咽部皰疹，可用西瓜霜、冰硼散、錫類散，任選1種，塗搽口腔患處，1日3次；吹敷口腔患處，或口腔炎噴劑噴患處，每日2次。口腔炎噴霧劑對扁桃體炎效果最為明顯；對小兒口腔炎有特效；具有一定的祛痰止咳效果；霧化劑型易吸收。
(3)手足皰疹嚴重者，可用如意金黃散、青黛散，任選1種，麻油調，敷於皰疹患處，1日3次。