引起牙結石的原因很多，如炎症、損傷、衛生習慣不良、個體差異（如唾液PH值高者易發生牙結石）等。同時，也與機體代謝、唾液成分、齦溝液成分、菌斑量、食物性質等有關，如食軟而帶粘性的食物易沉積牙石。此外，牙齒排列不齊、口腔衛生差等因素也可導致牙結石的出現。一般影響牙結石沉積的因素有：
1.與飲食習慣有一定關係，如若常吃軟性精細的食品，牙石沉積較快，反之攝入粗糙的食物則牙石沉積受阻。
2.攝入蔗糖多的人，由於牙菌斑形成多，軟性牙垢沉積較多。
3.牙麵粗糙、牙排列不整齊、有不易清潔的修複體等。
4.攝入含鈣、磷成分較多的食物，則牙結石形成較快。
5.沒有掌握正確的刷牙方法或未養成刷牙、漱口等口腔衛生習慣。
牙結石的產生為牙周疾病提供了菌斑附著、病菌滋生的良好場所。同時牙結石自身也容易吸附更多的細菌毒素，容易對軟組織造成刺激，使牙齦充血、水腫，還會引起刷牙時出血。若牙齦炎症繼續向深層組織發展，就會引起牙齦自發性出血和口腔異味。伴隨著牙槽骨的破壞，牙齒將鬆動、移位、咀嚼無力。因此，牙結石是牙周炎發生、發展的重要因素。
此外，牙結石附著在牙齒上，既影響美觀，也影響鑲牙修複的效果，牙結石的危害活動假牙(又稱可摘義齒)就會與牙麵不密合，容易導致食物殘屑積存在假牙上，引起口腔發炎。
根據牙結石沉積的部位，以牙齦緣為界，分為齦上牙石和齦下牙石。
齦上牙石，又稱唾石，是位於齦緣以上臨床牙冠表麵上的牙石，肉眼可以直接看見。其礦化物質來源於唾液，因此在唾液腺導管開口處相應處的牙麵上常常沉積較多。齦上牙石多呈黃色或白色，也可以由於吸煙或食物著色而呈深色。
齦下牙石又稱為血石，沉積於齦緣之下，附著在齦溝或牙周袋內的根麵，肉眼不可以直接看見，大塊齦下牙石可以在X線片上顯示。其礦化物質來源於齦溝液，一般呈褐色或黑色，與牙麵的附著較齦上牙石更牢固。
臨床發現，大部分成年人都有程度不同的牙結石。沉積在齦緣或齦溝內的結石，對牙齦造成持續性的刺激和壓迫，使牙齦組織局部營養障礙，抗菌能力降低，牙齦易出現炎症、出血、萎縮，嚴重時可引發牙周膿腫，牙齒鬆動、脫落，破壞牙列完整，妨礙咀嚼功能，如重消化道負擔，影響機體健康。
引起牙周病的基本原因是口腔衛生不良，主要致病菌是菌斑對於牙周病的預防主要是控製菌斑，保持口腔清潔，清除局部刺激 因素，提高宿主的抵抗力
刷牙是預防牙結石形成的一種簡便而又行之有效的方法牙結石的沉積是由少到多，逐漸形成的經常刷牙可將剛剛開始沉積於牙麵的牙垢、牙結石及時刷掉所以應該讓兒童堅持刷牙，如若等到牙結石沉積很厚、附著很緊密時，就刷不掉了，必須由大夫協助才能去除
另外由於精細食物粘性重糖分高，極易沉積於牙麵，因此，應告誡兒童少吃精細食品，或吃後必須刷牙漱口特別是睡前吃諸如餅幹、蛋糕等精細食品，不僅容易形成牙結石，而且還會造成齲齒所以平時一定要養成刷牙和保持口腔衛生的良好習慣
根據牙結石沉積的部位，以牙齦緣為界，分為齦上牙石和齦下牙石。
齦上牙石可以直接或通過口鏡觀察牙麵上的齦上牙石和軟垢的覆蓋麵積，進行檢查診斷。如一側牙石沉積明顯過於另一側，甚至咬合麵可見，則患者可能有偏側咀嚼習慣。
齦下牙石需由專業人員結合使用探針，在齦溝內沿牙麵從遠中劃向近中，探查齦下牙石情況。或用氣槍將牙齦緣吹開，有助於觀察齦下石。有時在X線上也可以觀察到鄰麵牙石。結合使用探針，在齦溝內沿牙麵從遠中劃向近中，探查齦下牙石情況。或用氣槍將牙齦緣吹開，有助於觀察齦下牙石。有時在X線上也可以觀察到鄰麵牙石。還應注意觀察牙石在口腔中的整體分布情況。
檢查評估指數：
牙石指數（calculus index，CI）
0-無齦上、齦下牙石
1-齦上牙石覆蓋牙麵不超過1/3
2-齦上牙石覆蓋牙麵超過1/3，但不超過2/3或牙頸部有散在齦下牙石。
3-齦上牙石覆蓋牙麵超過2/3或齦下牙石連續而厚。
牙結石病人應合理營養，粗細搭配。多吃富有維生素的粗纖維食物，如肉、蛋、各種蔬菜和水果，充分咀嚼以利於牙麵清潔。少吃甜食及粘性很強的食物，不吃零食。
目前還沒有藥物能有效安全地去掉牙結石(包括藥物牙膏)。最好的辦法還是超聲波潔治(洗牙)。洗牙後如不注意，牙石又會很快形成，所以洗牙後要繼續防治。注意正確的刷牙方法，有助於減少牙石的形成；洗牙後，過了一段時間局部仍會流血，則要請口腔科醫生小心檢查是否已有牙周病或牙齦深部尚有殘餘的牙結石存在，需要深層次潔牙——齦下潔治。