現代醫學認為，舌下囊腫的發病機理是由於導管阻塞後唾液瀦留使導管或腺泡破裂，分泌液向外滲出所致。祖國醫學認為，因心脾蘊熱，痰濕凝結，致邪熱上熏於口舌，熱盛陰傷，氣血俱燔，熱毒壅結而形成。多並發於溫熱病之中，繼發於病後之時，延誤診治者多預後不良。
本病和細菌感染具有直接的相關性，細菌感染可向周圍正常的組織蔓延，嚴重病例或者全身抵抗力低下的患者，可因感染進入血液循環造成膿毒血症等感染。同時本病的囊腫可直接壓迫食管以及氣管以及周圍組織，壓迫食管可影響進食，壓迫氣管可影響呼吸，甚至直接危及生命。
通常先起於一側口底舌下區，增大時可擴展於對側，有時也可擴展至頦下或同側頜下部。囊腫位於口底粘膜的深麵，呈淡黃色、半透明的柔軟包塊。觸診有波動感，無壓痛。增長緩慢。囊腫很大時，可影響說話、吞咽甚至呼吸。如並發感染可有疼痛等炎症表現。囊腫破裂時，溢出蛋清樣粘稠液體，包塊消失，但可複發。
術後處理
由於舌下囊腫常見不同程度的炎症細胞浸潤可見伴有炎性反應存在因而在激光手術後不論囊腫大小都應給予抗生素治療2周可口服、肌注或由靜脈滴注給藥同時還可給多簇維生素類製劑及有助於康複的方法治療如術後用弱激光照射創麵，一次20分鍾，1日1次，10～15次一療程，可減少用藥量
1、臨床體格檢查
口底舌下區，增大時可擴展於對側，有時也可擴展至頦下或同側頜下部。囊腫位於口底粘膜的深麵，呈淡黃色、半透明的柔軟包塊。觸診有波動感，無壓痛。增長緩慢。囊腫很大時，可影響說話、吞咽甚至呼吸。如並發感染可有疼痛等炎症表現。
2、臨床實驗室檢查
分泌物檢查可找到病原體，血常規檢查，白細胞明顯增高，以中性粒細胞增高為主。
較大囊腫請注意及時的進行手術治療。由於新生兒不能進食輔食，所以飲食無特殊要求，注意及時合理的喂養、加強營養即可。如果母乳喂養，乳母請注意加強營養，多吃瘦肉、雞湯、魚湯以及牛奶等高蛋白的食物，同時多吃點蔬菜、水果類等富含維生素和纖維素的食物，這樣能夠提高孩子的免疫力，對孩子有利。
由於舌下囊腫常見不同程度的炎症細胞浸潤可見伴有炎性反應存在。因而在激光手術後不論囊腫大小都應給予抗生素（頭孢克洛、頭孢噻肟、阿莫西林克拉維酸鉀均可）治療2周。可口服、肌注或由靜脈滴注給藥。同時還可給多簇維生素類製劑及有助於康複的方法治療。如術後用弱激光照射創麵，一次20分鍾，1日1次，10～15次一療程，可減少用藥量。