本病病因尚不明確，可能和環境因素、遺傳因素、飲食因素以及孕期的情緒、營養等具有一定的相關性。甲狀腺發生過程中，甲狀舌管未退化或未完全退化消失而產生的。可發生於自舌盲孔至胸骨上切跡之間的任何部位。其次也與咽部的感染刺激甲狀舌骨誘發瘺的形成。
本病由於甲狀腺瘺管的形成可有有膿液持續經瘺管排出，如果進入呼吸道則可能誘發吸入性肺膿腫，造成咳嗽、咳痰、發熱、胸痛、胸悶等表現。刺激咽部還可以引起嘔吐反射。囊腫巨大的患者，可直接壓迫氣管和食管，造成呼吸困難以及吞咽困難等並發症。
1、甲狀軟骨下可觸及異物撞擊震動感舌根部膿腫舌骨區有腫脹壓痛舌頭上有長時間不愈潰瘍咽部異物感瘺管或囊腫X線碘油造影有助於明確診斷，但應與鰓裂囊腫，皮樣囊腫及異位甲狀腺相鑒別。
2、甲狀舌囊腫內多覆有複層柱狀上皮，複層扁平上皮或移行上皮，囊液為粘液性，感染後為膿性，上皮下可見有甲狀腺組織。
3、甲狀舌囊腫位於舌骨以上的較小囊腫可無症狀，囊腫增大時才有舌內發脹，咽部異物感，發音不清，檢查見舌根部有一圓形隆起，位於舌骨以下，甲狀舌骨膜之前的囊腫較為多見，病人常無明顯症狀，檢查可見頸前皮下有半圓形隆起，表麵光滑質韌有彈性，與皮膚無粘連，可隨吞咽上下活動，穿刺囊腫可抽出半透明或混濁，稀稠不一的液體。
4、甲狀舌瘺管外瘺口常位於頦下與甲狀軟骨之間的頸前正中線上或稍偏向一側，瘺口可有分泌物外溢，如有繼發感染則有膿液外溢，從外瘺口注入美藍，如為完全性瘺管，可見舌盲孔處有美藍流出，經瘺口注入美藍不僅有助於診斷，還有利用於手術中能將瘺管完全切除。
本病病因尚不明確，可能和環境因素、遺傳因素、飲食因素以及孕期的情緒、營養等具有一定的相關性其與甲狀腺發生過程中，甲狀舌管未退化或未完全退化消失而導致本病故無法針對病因預防早期發現、早期診斷、早期治療，可減少本病的並發症，對本並發症的預防具有重要意義對於咽部有感染的患者應盡早治療，以減少本病的誘發
甲狀舌瘺管外瘺口常位於頦下與甲狀軟骨之間的頸前正中線上或稍偏向一側，瘺口可有分泌物外溢，如有繼發感染則有膿液外溢，從外瘺口注入美藍，如為完全性瘺管，可見舌盲孔處有美藍流出，經瘺口注入美藍不僅有助於診斷，還有利用於手術中能將瘺管完全切除。瘺管或囊腫X線碘油造影有助於明確診斷。
忌煙酒忌辛辣。忌油膩。忌吃生冷食物。以避免疾病反複發作。宜清淡為主，多吃蔬果，如香蕉、草莓、蘋果等。因其含有豐富的營養成分，多吃提高免疫力的食物，如蜂膠等。以此增強個人抵抗該疾病的體質。品種多樣化，應有一些基本營養素：蛋白質、維生素、礦物質和脂肪酸等。這些是營造身體免疫力的基本營養。少吃過於精細的食品，因為精細食品缺乏許多營養素。平時還要合理搭配膳食，注意營養充足。
手術方法：
1、患者仰臥，肩下墊枕，頭後仰。
2、切口在囊腫最隆起處，順皮紋做橫切口，如有瘺管則圍繞瘺口做橫梭形切口，分離上、下皮片。
3、暴露囊腫及分離瘺管縱行分離胸舌骨肌，暴露出囊腫包膜。為確定瘺管的行程及深度，由瘺管口或囊腫內注入美藍，以組織鉗抓住囊腫或瘺管的皮膚開口向舌骨方向分離，術中應注意不要傷及喉上神經及血管。
4、切除舌骨中部分離至舌骨體時，仔細檢查管道盲端是否止於此處，若止於此處則將瘺管與囊腫一並切除。若管道繞舌骨上升，則應在舌骨中線兩側各0.7～1cm處切斷，去除1.5～2cm長的舌骨。沿中線剪開舌骨舌肌，順瘺管向舌體深部分離至舌根。此時食指伸入口內將舌根盲孔推向前下，在手術野後方可見一突起點，此時瘺管的終點，將瘺管剪除，以腸線縫合舌盲孔處缺損。
5、逐層縫合切口，並置橡皮引流條。