亞急性甲狀腺炎病因多認為是由於病毒感染引起的變態反應，如柯薩奇病毒、腮腺炎病毒、流感病毒、腺病毒感染等，也可發生於非病毒感染（如Q熱或瘧疾等）。近年來研究發現遺傳因素也可能參與發病，在患亞急性甲狀腺炎的雙胞胎患者中發現患者的HLA-B35自身抗原和感染病毒的相關抗原T細胞可發生交叉反應，從而引起機體的自身免疫反應，導致甲狀腺細胞的損害。
亞急性甲狀腺炎可以合並甲亢：
1、臨床上甲亢患者主要表現為：心慌、心動過速、怕熱、多汗、食欲亢進、消瘦、體重下降、疲乏無力及情緒易激動、性情急躁、失眠、思想不集中、眼球突出、手舌顫抖、甲狀腺腫或腫大、女性可有月經失調甚至閉經，男性可有陽痿或乳房發育等。甲狀腺腫大呈對稱性，也有的患者是非對稱性腫大，甲狀腺腫或腫大會隨著吞咽上下移動，也有一部分甲亢患者有甲狀腺結節。
2、甲亢時引起的眼部改變，一類是良性突眼，患者眼球突出，眼睛凝視或呈現驚恐眼神；另一種是惡性突眼，可以由良性突眼轉變而成，惡性突眼患者常有怕光、流淚、複視、視力減退、眼部腫痛、刺痛、有異物感等，由於眼球高度突出，使眼睛不能閉合，結膜、角膜外露而引起充血、水腫、角膜潰爛等，甚至失明。也有的甲亢患者沒有眼部症狀或症狀不明顯。上述均是典型甲亢的臨床表現，但是並非每位甲亢患所有的臨床症狀都有，不同類型的甲亢，臨床表現也不同。
3、甲狀腺激素分泌過多的病理生理作用是多方麵的，但其作用原理尚未完全闡明。以往認為過量的甲狀腺激素作用於線粒體，對氧化磷酸化過程具有拆偶聯的作用。以致氧化過程所產生的自由能，不能以ATP的形式貯存而消耗殆盡，故氧化率增加而能源供應不足，從而引起臨床症狀。
SAT常在病毒感染後1-3周發病，有研究發現該病有季節發病趨勢（夏秋季節，與腸道病毒發病高峰一致），不同地理區域有發病聚集傾向。起病形式及病情程度不一：
1、上呼吸道感染前驅症狀：肌肉疼痛、疲勞、倦怠、咽痛等，體溫不同程度升高，起病3-4d達高峰。可伴有頸部淋巴結腫大。
2、甲狀腺區特征性疼痛：逐漸或突然發生，程度不等。轉頸、吞咽動作可加重，常放射至同側耳、咽喉、下頜角、頦、枕、胸背部等處。少數患者聲音嘶啞、吞咽困難。
3、甲狀腺腫大：彌漫或不對稱輕、中度增大，多數伴結節，質地較硬，觸痛明顯，無震顫及雜音。甲狀腺腫痛常先累及一葉後擴展到另一葉。
如何有效的預防亞急性甲狀腺炎：
1、規律運動亞急性甲狀腺炎病因多考慮與病毒感染相關，故需規律運動，增強體質，預防感染
2、生活節製注意休息、勞逸結合，生活有序，保持樂觀、積極、向上的生活態度對預防疾病有很大的幫助做到茶飯有規律，生存起居有常、不過度勞累、心境開朗，養成良好的生活習慣對預防亞急性甲狀腺炎有益
3、合理膳食可多攝入一些高纖維素以及新鮮的蔬菜和水果，營養均衡，包括蛋白質、糖、脂肪、維生素、微量元素和膳食纖維等必需的營養素，葷素搭配，食物品種多元化，充分發揮食物間營養物質的互補作用，對預防此病也很有幫助
1、白細胞計數及中性粒細胞正常或偏高，紅細胞沉降率增速，血清蛋白結合碘或血清T3、T4、FT3與FT4濃度升高，甲狀腺攝碘率降低，甲狀腺掃描可見甲狀腺腫大，但圖象顯影不均勻或殘缺，亦有完全不顯影的。蛋白電泳呈現為白蛋白減少，球蛋白增加，主要是r和α1球蛋白增高。
2、實驗室檢查見白細胞輕度或中度升高，血沉明顯增快，由於甲狀腺濾泡細胞被破壞濾泡內貯藏的甲狀腺素三碘甲腺原氨酸及甲狀腺球蛋白排入血中含量均增加；甲狀腺濾泡細胞被破壞功能喪失吸碘率降低；血中抗甲狀腺抗體增加很少；促甲狀腺激素降低。
3、血常規檢查白細胞總數一般正常或稍高。血沉增速。紙上蛋白電泳顯示患者球蛋白水平升高，尤其是α2球蛋白升高。甲狀腺功能檢查常有131Ⅰ吸碘率下降。血漿蛋白結合碘升高。總T3、T4水平升高或正常，TSH水平降低，有的患者中後期T3、T4水平偏低或正常。TGA陽性，部分TMA也可陽性。當亞急性甲狀腺炎的症狀消失，其甲狀腺功能與生化檢查正常以後，血清TGA仍可呈陽性，本病可以亞臨床形式存在較長時期。
1、心理調整：首先要了解亞急性甲狀腺炎的病因，臨床表現，轉歸和預後，對自己的疾病有一個基本了解，解除焦慮和緊張情緒，保持樂觀的態度，積極配合醫生治療。
2、合理膳食：少食多餐，避免暴飲暴食，營養均衡。
3、有效休息：需保證充足的睡眠，注意休息，避免勞累，減少不良刺激，急性期要臥床休息，減少能量消耗，運動要適度。
4、按時複診：明確了疾病的分期和轉歸，需遵醫囑，按時複診檢查、指導用藥及對治療藥物副作用的觀察。以避免複發和合並甲減、提高治愈率。
1、早期治療以減輕炎症反應及緩解疼痛為目的。輕症可用乙酰水楊酸（1-3g/d，分次口服）、非甾體消炎藥（如吲哚美辛75-150mg/d，分次口服）或環氧酶-2抑製劑。糖皮質激素適用於疼痛劇烈、體溫持續顯著升高、水楊酸或其他非甾體消炎藥治療無效者，可迅速緩解疼痛，減輕甲狀腺毒症症狀。初始潑尼鬆20-40mg/d，維持1-2周，根據症狀、體征及ESR的變化緩慢減少劑量，總療程6-8周以上。過快減量、過早停藥可使病情反複，應注意避免。停藥或減量過程中出現反複者，仍可使用糖皮質激素，同樣可獲得較好效果。甲狀腺毒症明顯者，可以使用β-受體阻滯劑。由於本病並無甲狀腺激素合成增多，故不使用抗甲狀腺藥物治療。甲狀腺激素用於甲減明顯、持續時間久者；但由於TSH降低不利於甲狀腺細胞恢複，故宜短期、小量使用；永久性甲減需長期替代治療。
2、手術治療是不適宜的，除非伴有甲狀腺腫瘤者，或極少數疼痛長期不能緩解者，才需切除病變的甲狀腺。
3、中醫中藥對本病有一定的療效，一般與以上藥物同時並用，主要治療原則為：清熱解毒，益氣固表，疏肝散結。