引起腸吸收不良的病因可由很多種，也很複雜，在營養物質消化吸收過程中，任何環節出現故障均可導致吸收不良綜合征。腸道對相同類型營養元素的吸收不良的原因也多不相同。
糖吸收不良主要是小腸黏膜缺乏特異性雙糖酶，使食物中雙糖不能充分被水解為單糖影響其吸收，也偶見單糖吸收發生障礙。澱粉酶除新生兒外，罕見缺乏，一般不引起臨床問題。人體經口攝入的碳水化合物主要有澱粉、乳糖及蔗糖，它們必須經過消化、水解為單糖後才能被小腸吸收。澱粉包括直鏈及支鏈兩種，均為葡萄糖的多聚體，唾液及胰腺中的澱粉酶，可水解澱粉，使其分解為麥芽糖(含二個分子葡萄糖)、麥芽寡精(由幾個分子葡萄糖組成)及糊精。小腸上皮細胞刷狀緣上的糊精酶(即異麥芽糖酶)可水解糊精分子，麥芽糖酶可進一步水解麥芽糖最終將這些糖均分解成葡萄糖方可被吸收。糖吸收不良的類型可分為糖吸收不良可分為原發及繼發兩類。
1、原發性糖吸收不良：
吸收不良是由於Na -葡萄糖，Na -半乳糖載體蛋白先天缺乏所致，病兒果糖吸收良好。
2、繼發性乳糖酶缺乏及單糖吸收不良：
因乳糖酶分布在小腸絨毛的頂端，凡能引起小腸黏膜上皮細胞及其刷狀緣受損的疾病均可繼發雙糖酶缺乏，病變嚴重、廣泛，也可影響單糖的吸收，例如急性腸炎(尤其累及小腸上部者，如輪狀病毒腸炎、藍賈第鞭毛蟲感染等)、慢性腹瀉、蛋白-熱卡營養不良、免疫缺陷病、乳糜瀉及小腸手術損傷等。
3、脂肪吸收不良：
脂肪吸收不良又稱脂肪瀉，是脂肪消化、吸收不良所致的綜合征可在多種疾病中見到，如胰、肝、膽及腸道疾病。
由於腸道病變引起的脂肪瀉，多同時伴有其他多種營養素的吸收不良，稱吸收不良綜合征。
4、蛋白質吸收不良：
由腸黏膜滲出丟失，如牛奶或豆蛋白耐受不良、乳糜瀉、藍賈第鞭毛蟲病、炎性腸病及腸淋巴管擴張症等均可發生蛋白質由腸道丟失，可通過測定糞便中α1抗胰蛋白酶證實此蛋白存在於血漿，不能在腸道內被消化水解，因此當腸黏膜有蛋白滲出時，可在糞便中測到α1抗胰蛋白酶。
腸吸收不良指小腸消化及(或)吸收功能減退，使腸腔內一種或多種營養成分不能被順利轉運至體內，而從糞便中排出，使患兒發生營養缺乏。常為多種營養成分均有不同程度吸收障礙。
腸吸收不良導致的並發症主要是由於各種營養素的缺乏，而導致蛋白質熱能營養障礙、各種維生素和礦物質缺乏、消瘦、貧血等，由於大量損失腸液常並發脫水酸中毒、水電解質代謝紊亂。小兒反複腹瀉會出現臀紅、濕疹等。
腸吸收不良的原因的表現有很多，可分為一般性表現和特異性表現。其中，一般性表現有腹瀉、體重減輕、乏力、維生素和礦物質缺乏等，特異性表現根據營養成分的不同而不同。具體表現如下：
1.一般性表現
(1)腹瀉：常為吸收不良綜合征的主訴，由未被吸收的營養物質影響腸道功能所致。糖類在結腸中發酵產生腹脹和食欲不振，水分吸收緩慢可致夜尿增多。常伴有腹部不適和腸鳴音活躍。腹痛多見於慢性胰腺炎、腸梗阻性病變或腸缺血者。
(2)體重減輕、乏力、水腫：由於營養物質吸收不足及食欲不振，常表現為體重減輕或體重不增、倦怠、乏力。嚴重持續的營養不良可表現為進行性營養不良、生長發育遲緩、甚至惡病質。長期蛋白質吸收不良和不斷地從腸腔丟失血漿蛋白質可引起低蛋白血症和周圍性水腫。腹瀉嚴重者可出現水、電解質及酸堿平衡紊亂；病程遷延者常出現營養不良、貧血及生長發育障礙。
(3)維生素和礦物質缺乏的表現：如鐵、葉酸或維生素B12 吸收不良所致的貧血，脂肪吸收不良所致的脂溶性維生素K 吸收不良和低凝血酶原血症而引起的出血傾向，長期維生素D、鈣、鎂缺乏引起的手足搐搦症，脂肪瀉患者可出現骨質疏鬆或病理性骨折，慢性低鈣血症可致繼發性甲狀旁腺功能亢進，吸收不良患者可由於維生素A 缺乏而表現為夜盲症、皮膚粗糙及過度角化。
2.主要營養物質吸收不良的特殊表現
(1)糖吸收不良：正常人乳糖攝入後被小腸黏膜刷狀緣的乳糖酶水解為葡萄糖和半乳糖而吸收，各種原因造成小腸黏膜乳糖酶缺乏，使牛奶中特有的乳糖不能在小腸內充分水解和吸收，造成乳糖吸收不良。糖吸收不良可分為原發性和繼發性兩大類，引起原發性糖吸收不良的疾病有先天性乳糖吸收不良、蔗糖-異麥芽糖酶缺乏、葡萄糖-半乳糖吸收不良等；而引起小腸黏膜上皮細胞和刷狀緣損害的疾病，如病毒性腸炎、慢性腹瀉病、蛋白-熱量營養不良、免疫缺陷病、小腸手術後等，均可引起繼發性糖吸收不良。
(2)脂肪吸收不良：最常見的症狀是腹瀉、腹痛、腹脹、嘔吐等，大便主要是脂肪瀉，糞便量多、色淡、油脂狀、惡臭。由於吸收不良，可引起體重減輕、營養不良性貧血、低蛋白血症、口腔炎、繼發脂溶性維生素缺乏的症狀、生長發育滯後等。
(3)蛋白質吸收不良：單純的蛋白質吸收不良罕見，一般均在腸黏膜廣泛受損時，與脂肪或糖吸收不良同時發生。其臨床表現是糞便顏色淺，有臭皮蛋氣味，並出現與低蛋白血症有關的症狀，如水腫、腹水等，而尿蛋白常陰性。
因該疾病多數為繼發性吸收不良，病因複雜，無法做到有針對性的預防總的預防措施為加強合理喂養，增強體質，防治胃腸道各種疾病和營養障礙性疾病等主要應做到以下幾點：
1、加強合理喂養，多進食富含維生素的新鮮蔬果
2、防治胃腸道各種疾病和營養障礙性疾病等
3、增強體質，提高自身免疫力：注意勞逸結合，多參加體育鍛煉
引起腸吸收不良的病因很複雜，在營養物質消化吸收過程中，任何環節出現故障均可導致吸收不良綜合征。腸道對相同類型營養元素的吸收不良的原因也多不相同。因此，對於該疾病應進行全麵的檢查。
1.篩選試驗（1）糞便pH測定：糖耐受不良兒新鮮糞便pH多＜6，且經常低於5.5（2）糞便還原糖測定：取新鮮糞便1份，加水2份混勻後離心，取上清液1ml，加入Clinitest試劑1片通過與標準卡比色，獲得還原糖濃度≥0.5g/dl為陽性，新生兒＞0.75g/dl為異常。上述上清液也可加斑氏（Benedict）液後加熱，測還原糖由於蔗糖不是還原糖，需將1份糞便加2份1N的HCl，加熱後取上清液，此時蔗糖已被水解為單糖，可按上述方法再測還原糖。由於未被吸收的蔗糖常在結腸內已被細菌分解為還原糖，因此實際上常不需先加HCl水解，但如加酸處理後，糞糖比未處理時顯著增加提示病兒有蔗糖吸收不良健康搜索。糞便中含有其他還原物質如維生素C可呈現假陽性。
2.糖-呼氣試驗：方法敏感、可靠、簡便，且無創傷性，但需氣相色譜儀測呼氣中氫含量。人體本身不能產氫，呼氣中氫乃由結腸內糖被細菌發酵所產生。正常人對絕大多數可吸收的糖類在到達結腸前可完全吸收而腸道細菌發酵代謝未被吸收的糖類是人體呼氣中氫氣的惟一來源，利用這一原理可測定小腸對糖類的吸收不良。攝入某種試驗糖前後，測定呼氣中的氫氣或14CO2，攝入試驗糖後如呼氣氫升高或呼氣14CO2降低表示對該試驗糖吸收不良。可在晚間禁食8～12h後測呼氣氫作為基數，隨即口服待測糖2g/kg最多不超過50g有人主張將劑量減至0.25～0.5g/kg，以減少誘發糖耐受不良症狀。每隔半小時收集呼氣測氫含量，共2～3h。如氫總量超過空腹時基數值20×10-6ppm，可診斷為被測試糖吸收不良病兒用抗生素可抑製腸道細菌，可出現假陰性。
3.小腸黏膜活檢可通過內鏡或經口插入Crosby腸活檢導管，負壓切取薄層腸黏膜，分別進行組織學檢查及直接測定各種雙糖酶含量尤其有利於先天性糖吸收不良的診斷。
4.右旋木糖吸收試驗：在腎功能正常健康搜索的情況下測定尿內木糖的排出量，可反映小腸的吸收功能該試驗對診斷小腸黏膜普遍性損害所致吸收不良的陽性率達70％以上；對胰腺疾病和僅累及回腸的疾病，木糖試驗陽性；腎功能不全者或胃排空延遲者，可出現假陽性。方法：空腹服右旋木糖5g（溶於250ml水中）再飲水200～300ml，收集5h的尿，測定尿內木糖含量。正常值（1.51±0.21）g如排出量為1～1.16g為可疑，＜1g為異常。嬰幼兒不易采集尿液可測定1h後血中木糖含量，如＜200mg/L視為吸收不良。
5.維生素B12吸收試驗或Schilling試驗：先肌內注射維生素B121mg，使體內庫存飽和，然後口服60Co（鈷）或57Co標記的維生素B122μg，收集24h尿液，測定尿內放射性含量。正常人經尿排出量應大於口服量的8％～10％。低於此值為吸收不良，常見於回腸末端吸收不良或被切除後腸內細菌過度繁殖（如盲襻綜合征）及內因子缺乏所致惡性貧血等。
6.14C-甘氨膽酸呼氣試驗：口服14C-甘氨膽酸370MBq（10mCi），正常人絕大部分在回腸吸收，循環至肝髒再經膽管進入小腸僅極少部分能進入結腸而從糞便排出另一部分則在體內代謝成14CO2通過肺呼出。正常人口服14C-甘氨膽酸後4h內14C02的排出量低於總量的1％，24h糞內排出小於8％。小腸細菌過度繁殖回腸末段病變或外科切除者呼氣中14CO2和糞內14CO2的排出量增高。
7.腸液檢查插管至十二指腸或空腸抽取腸液，做鏡檢或細菌培養；測定腸液中胰酶的活力以評價胰腺功能等。
8.汗氯測定：汗氯＞60mmol/L有助於胰腺囊性纖維性變的診斷。
9.其他如糖耐量試驗：口服2g/kg受試糖後健康搜索，如糖耐量曲線低平，提示存在吸收不良，但血糖可受多種因素影響，結果需結合臨床才有意義。用層析法可測定糞糖，並區別各種不同種類的糖，也有采用醋酸鉛法測定糞便中乳糖，這些方法對診斷均有參考意義。
病人的日常飲食對病情的康複有著非常重要的作用，尤其是含有胃腸類疾病的患者，飲食的作用尤為明顯。對於該病的患者應該注意：禁用麥食，多用各種維生素和蛋白質，少進脂肪和碳水化物，避免多渣食物，供給充足水分。治療初期不用澱粉類食物，而較多給葡萄糖和果糖。可較多給蛋白乳及乳酸去脂牛乳，因富於蛋白質，應作為主要飲食。此外如豆製品、雞蛋白、瘦牛肉、魚、雞肉、肝及豬舌等蛋白質可做成泥和易消化的軟食，逐漸增加，以維持患兒營養。也可給熟香蕉或香蕉粉。注意加用魚肝油或維生素A、D製劑及鈣劑。以後逐漸加全牛乳、水果泥、菜泥、麥芽糖及蔗糖等。最後才添加澱粉食品，可先從藕粉類澱粉製品開始，然後試用糕幹粉、米粉、代乳粉等。對加用麥粉類食物要十分慎重。如再出現消化吸收不良，應恢複最簡單的食品，以後再逐漸添加其他食物，和治療初期一樣。
中醫認為，腸吸收不良綜合征屬中醫“虛勞”、“虛損”、“脾痿”範疇，多因胃腸等消化係統慢性疾病導致長期厭食、久瀉，終而引起脾氣痿弱、腎氣受損、精氣匱乏，整個機體失充營養的虛損病證，病位在脾、胃、腎，病性以虛為主。中醫辨證分為脾虛血虧、脾虛濕困、脾胃虛寒、脾腎陽虛四型施治，獲得了比較滿意的臨床療效。
1.脾虛血虧型：症見久不欲食、脘腹脹滿、大便溏薄、形體消瘦、神疲乏力、氣短懶言、舌質淡、苔薄白、脈細弱。治宜補脾養血。方用歸脾湯加減。藥用西洋參、炙黃芪、炒白術、朱茯神、炒棗仁、桂圓肉、廣木香、當歸、遠誌、炙甘草、生薑、大棗、首烏、黃精等。
2.脾虛濕困型：症見脘腹脹痛、腸鳴腹瀉、惡心嘔吐、形體消瘦、神疲乏力、氣短懶言、舌淡胖、邊有齒痕、苔白膩、脈濡緩。治宜補脾益氣、除濕止瀉。方用蒼白二陳湯化裁。藥用蒼術、白術、法半夏、陳皮、茯苓、黨參、炙甘草、砂仁、炒苡仁、炒扁豆等。
3.脾胃虛寒型：症見長期腹瀉、反複發作、大便稀溏如油狀、脘腹脹痛、喜溫喜按、惡心嘔吐、食納呆滯、畏寒肢冷、形體消瘦、神疲乏力、或見水腫、舌淡胖、邊有齒痕、苔薄白、脈沉緩。治宜溫中散寒、化濕止瀉。方用良附丸合理中湯加味。藥用高良薑、香附、炒白術、炙黃芪、幹薑、黨參、炙甘草、炒苡仁、炒扁豆等。
4.脾腎陽虛型：症見久瀉不愈、腹痛隱隱、腸鳴腹脹、大便稀溏、形寒肢冷、神疲倦怠、食少納呆、腰膝酸軟、舌淡、苔白、脈弱。治宜溫補脾腎，固腸止瀉。方用自擬愈腸煎。藥用炒石榴皮、補骨脂、肉豆蔻、五味子、煨柯子、炙米殼、吳茱萸、大棗、附子、幹薑、茯苓、苡仁、赤石脂、禹餘糧、杜仲、鎖陽、台烏、沉香、肉桂、小茴香等。