男性非淋菌性尿道炎的並發症
前列腺炎
急性期排尿有較劇烈的疼痛感，並向尿道、陰囊和臀部方向放射。直腸有墜脹。也可合並排尿困難和陰莖痛性勃起，少數伴有發熱或全身不適。直腸指檢有前列腺腫大和壓痛。尿中可出現透明絲狀物或灰白色塊狀物。多數患者開始時即為慢性表現，表現為排尿不適、有會陰部、腹股溝、恥骨聯合上部、腰背部的輕微疼痛或酸脹感。檢查時前列腺呈不對稱腫大、變硬或硬結。
附睾炎
可分急性和慢性。急性非淋菌性附睾炎較少見，發生率為1％，常與尿道炎症同時存在，多為單側性。表現為附睾腫大，變硬，輸精管增粗、觸痛，也可有陰囊水腫。慢性期時，附睾尾部可有硬結和精索增粗。常可因性生活過度和酗酒等誘因引起急性發作。附皋炎時血清抗體有明顯增高，因此，血清學檢查對附睾炎的診斷有較大意義。
精囊精索炎
精囊精索炎：常與前列腺同時存在。其臨床表現與前列腺炎相似，同時有精液帶血、射精痛和遺精次數增多等症狀。直腸指檢可發現前列腺上界兩側壓痛、腫脹或有條束狀物。
Reiter病
Reiter病：患者有尿道炎、眼結膜炎和多發性對稱性關節炎。部分患者有陰莖頭和包皮內的淺表糜爛，邊緣稍高，融合成多環狀，稱為環狀陰莖頭炎。受累的關節以膝、跺和肘為多見。關節病變可長達數月，偶爾並發心肌炎、胸膜炎和多發性神經炎，抽取關節滲出液有時可查出衣原體。血清中抗衣原體抗體滴度亦有所升高。但Reiter綜合征可能由多種原因引起，衣原體感染僅可能是其中之一。
女性沙眼衣原體感染的並發症
急慢性盆腔炎
急性盆腔炎時表現為發熱、頭痛、食欲不振和下腹部疼痛，可伴有腹脹、惡心和嘔吐等消化道症狀。檢查時下腹部有壓痛和反跳痛，子宮體壓痛和活動度受限，宮體兩側有壓痛，有時可們及腫物。慢性盆腔炎時全身症狀多不明顯，主要表現為下腹部墜脹感和疼痛、腰酸和白帶增多等。卵巢功能受影響時出現月經不調。子宮內膜炎時可使月經量增多、經期延長或縮短、下腹部鈍痛。子宮體活動受限，一側或兩側輸卵管增粗呈條索狀，有時可們及囊性腫物，周圍有壓痛。反複發作可導致輸卵管阻塞而出現不孕和異位妊娠、流產、早產和死胎等。
前庭大腺炎
在小陰唇和處女膜間的腺體開口處出現潮紅、水腫和局部疼痛，嚴重時可出現膿腫。慢性反複發作可形成囊腫，檢查時可觸及腫大的腺管及腺體。
直腸炎
患者可有肛門疹癢、疼痛及豁液性分泌物。可見於男性同性戀患者，或是由於病原體的分泌物從泌尿生殖道感染肛門所致。
1.典型表現有尿道刺癢，伴有尿急、尿痛及排尿困難，但症狀較淋菌性尿道炎輕。
2.在較長時間不排尿或清晨首次排尿前，屎道口可出少量黏液性分泌物，有時僅表現為痂膜封口或褲檔汙穢。有相當一部分人可無任何症狀。
3.男性患者可發生附睾炎。女性患者不如男性典型，很多病人可無症狀，一般可發生尿道炎、黏液膿性宮頸炎、急性盆腔炎症性疾病及不育症等。
1、杜絕不潔性交，正確避孕
避孕藥中的雌激素有促進黴菌侵襲的作用如果反複發生非淋菌性尿道炎，就盡量不要使用藥物避孕
2、女性護理液更適合日常的清潔保養
頻繁使用藥字號洗液、消毒護墊等，容易破壞陰道弱酸性環境，陰道的弱酸性環境能保持陰道的自潔功能，Ph4弱酸配方的女性護理液更適合日常的清潔保養
3、注意公共場所衛生
公共浴堂的衛生也很重要，不提倡洗盆塘，衣服要單獨存放公共場合可能隱藏著大量的病菌出門在外，不要使用賓館的浴盆、要穿著長的睡衣、使用馬桶前墊上衛生紙等等同時可選用個人清潔護理產品，常備女性衛生護理濕巾
4、伴侶同治
如果你感染了黴菌性陰道炎，需要治療的不僅是你，還有你的伴侶，這樣才會有預期的療效平時日常使用女性護理液的同時也準備一支男性護理液給男性使用
5、穿著全棉內褲
緊身化纖內褲會使陰道局部的溫度及濕度增高，這可是黴菌拍手稱快的“居住”環境，還是選用棉質的內褲吧！所以請選擇全棉內褲
常規檢查方法有：
1.直接免疫熒光法
將特異的衣原體單克隆抗體用熒光素標記後檢測標本中的衣原體抗原，如標本中有衣原體，則和抗體結合，在熒光鏡下可見蘋果綠色的熒光，一張塗片中衣原體數在10個以上時為陽性，特異性>97％，敏感性為70％～92％。
2.酶聯免疫法
用光譜測相儀檢測泌尿生殖道中的衣原體抗原，發現顏色改變為陽性，24小時獲得結果，敏感性為60％～90％，特異性為92％～97％。
3.沙眼衣原體培養
沙眼衣原體為專性細胞內寄生物，隻有在活細胞中才能生長繁殖，常用於衣原體培養的細胞是McCoy細胞和Hela229細胞，特異性為99％～100％，敏感性為68.4％～100％，是目前診斷沙眼衣原體的金標準。沙眼衣原體是在柱狀上皮細胞內寄生的微生物，合適的培養標本是應用拭子從距尿道內口2～4mm以內的尿道內取出，而不是取尿道口的分泌物或尿液作培養。
4.解脲支原體培養
利用解脲支原體能分解精氨酸產氨，發酵葡萄糖產酸的原理，分別使含精氨酸的肉湯培養基變為堿性，指示劑顏色由黃變紅，葡萄糖肉湯培養基由粉紅色變為黃色，該方法簡便、客觀、價廉，已廣泛應用於臨床。
5.聚合酶鏈反應（PCR）和連接酶聯反應（LCR）
敏感性和特異性均優於其他方法，但要注意防止汙染造成的假陽性。
1、忌辛辣食品
辛辣食品(辣椒、薑、蔥、蒜等)多食易生燥熱，使內髒熱毒蘊結，從而使本病症狀加重。
2、忌海鮮發物
腥膻之品，如桂魚、黃魚、帶魚、黑魚、蝦、蟹等水產品可助長濕熱，不利於炎症的消退，故應忌食。
3、忌甜膩食物
油膩食物如豬油、肥豬肉、奶油、牛油、羊油等，高糖食物如巧克力、糖果、甜點心、奶油蛋糕等，這些食物有助濕增熱的作用，並影響治療效果。
非淋菌性尿道炎確診後，采用廣譜抗生素療法，並且強調要連續不間斷用藥，要規則、定量、徹底治療。治療後10-20天複查再次均為陰性，並用臨床症狀消失為治愈。本病治療時所需的療程較長。
藥物治療
根據中華人民共和國衛生部衛生防疫司《性病防治手冊》推薦方案：
1、治療由衣原體或支原體引起的成人無並發症尿道炎和宮頸炎的推薦方案：多西環素100mg，口服，每日2次，連續7d；或鹽酸四環素500mg，口服，每日4次，至少連服7d，一般為2一3周。也可在7d後改為250mg，每日4次，直至21d；或美滿黴素100mg，口服，每日2次，連服10d；或土黴素250mg，口服，每日4次，連服7d.由於孕婦不宜用四環素，可改用對肝髒損害較小的紅黴素治療，紅黴素治療劑量為500mg，口服，每日4次，連服7d。口服藥外，另用含PHMB殺菌成分的嬌妍潔陰洗液內洗外洗配合治療。
2、對患者的性伴侶也應進行檢查和治療。
3、由於耐青黴素淋球菌菌株的流行，以及多達45％的淋病患者在感染淋球菌的同時也感染衣原體，而尚缺乏快速、可靠的檢測衣原體的方法，故采用頭抱曲鬆鈉(250mg，1次肌注）和多西環素（100mg，口服，每日2次，連續7d）聯合治療淋病和NGU。
治愈的標準是患者的自覺症狀消失，無尿道分泌物，尿沉渣無白細胞，無任何後遺症。