先天性軟齶裂的起因可能是遺傳因素、甲狀腺素缺乏、擅自用藥等。
1、遺傳因素：遺傳因素主要是因為胚胎在發育的過程中遺傳了父親或者是母親的基因，這樣就會引起先天性軟齶裂。
2、甲狀腺素缺乏：甲狀腺素缺乏是由於甲狀腺素缺乏以後會影響到苯丙氨酸的代謝，甚至還會引起代謝異常，這樣就會誘發唇齶裂。
3、擅自用藥：擅自用藥主要是因為在懷孕期間服用了一些激素類含量比較高的藥物，這樣就會影響到胎兒的發育，甚至還會引起胎兒出現先天性軟齶裂的情況。
除了以上比較常見的原因以外，如果在懷孕以後經常接觸一些輻射比較嚴重的電子產品，也會引起寶寶出現先天性軟齶裂。
