專家研究表明，即使完全合格的桶裝水在飲水機上使用時，細菌依然會進入飲水機內部並在貯水箱及冷水管道內壁滋生繁殖，而大部分飲水機的貯水箱溫度在30攝氏度左右，是培養細菌的“溫床”，20分鍾左右就能繁殖一代。
專家采樣檢測發現，在清潔的環境下，每立方米空氣中有4000個左右的細菌。隨著桶裏的水越來越少，空氣越來越多，進入水體的細菌數也可想而知。
同時，在飲水機自儲水膽中，一直有近1000毫升左右的水殘存，也是被忽略而容易滋生細菌的地方。一桶水用完又換下一桶，往往忽視了飲水機內膽還存有近1000毫升的“陳水”，久而久之細菌便開始滋生。長此下去將對人體的健康產生威脅。
專家建議，桶裝水最好能在一周內飲用完，長時間的陽光照射也會導致細菌繁殖，因此，一年四季飲水機最好放在陰涼處，避免陽光的照射。飲水機的清潔和消毒也相當重要，夏天一個月清洗一次，冬天也不能忽視，至少一季度清洗一次。
