食道活檢鱗狀上皮增生有可能是淺表性胃炎，反流性食管炎或者食管癌所導致。一般根據誘發的原因治療，才能夠達到良好的改善效果。
1、淺表性胃炎：多數是幽門螺杆菌感染所導致的，而且與反流因素也有著很大的關係，通常會導致人體出現消化不良、上腹痛、噯氣、反酸、惡心等不適的症狀，當發生反酸後，就有可能會導致食道活檢時出現鱗狀上皮增生症狀。可以在醫生指導下口服阿莫西林膠囊、蘭索拉唑腸溶膠囊、膠體果膠鉍膠囊等藥物進行治療。
2、反流性食管炎：可能是因為酸反流所導致的食管黏膜破裂所致，而且與抗反流功能下降有一定的關係，如果不及時治療有可能會導致食管黏膜出現充血、糜爛、潰瘍等症狀，從而引起食道在活檢時有鱗狀上皮增生問題。一般可以在醫生指導下口服鋁碳酸鎂片，枸櫞酸莫沙必利片、奧美拉唑腸溶膠囊等藥物進行治療。
3、食道癌：有可能是長時間吸煙喝酒所引起的，而且與進食過燙食物也有一定關係，在發生食道癌後，有可能會導致吞咽困難、持續性胸骨後疼痛或者背痛的症狀，在進行食道活檢的時候，有可能會導致鱗狀上皮增生問題。對於早期的食道癌，可以在醫生指導下采取手術切除緩解。若是病情較為嚴重，處於中晚期或者晚期，還需要通過放射治療以及化學治療等方式的改善。
