研究表明尿道綜合征主要與以下原因有關：
1、泌尿係統感染，患者尿道口組織的病理改變均為慢性炎症反應。
2、尿道梗阻：如膀胱頸梗阻、尿道遠端周圍組織纖維化或括約肌痙攣導致遠端尿道縮窄。
3、尿道外口解剖異常，如尿道處女膜融合、處女膜傘、小陰唇融合等。有報道，尿道外口至陰道口距離與尿道綜合征關係密切，間距越近患病率越高，間距在3mm以下者患病率達72.15％。
4、神經功能異常，損傷、感染、X線照射等引起尿道內纖維組織增生，使神經發生異常反射。
5、心理因素。如緊張焦慮、多疑及內向等心理狀態是尿道綜合征的易感因素。
6、其他，如免疫因素、雌激素水平下降、鎂離子缺乏、醫源性因素等。
尿道綜合征的並發症根據性別不同有所區別，具體如下：
男性患者的並發症：附睾炎、前列腺炎、精囊炎等；
女性患者的並發症：子宮內膜炎、輸卵管炎、盆腔炎、腹膜等。
尿道內感染可直接蔓延到膀胱或前列腺而引起膀胱炎或前列腺炎。尿道綜合征若處理不當可並發尿道旁膿腫，膿腫可穿破陰莖皮膚成為尿道瘺。在尿道炎症愈合過程中纖維化則可引起尿道狹窄。
尿道綜合征的症狀：有尿頻、尿急、尿痛症狀，部分病人伴尿道燒灼感及排尿困難症狀，同時可出現恥骨上膀胱區痛、腰痛和性交痛等。
尿道綜合征的預防措施如下：
1、保持局部幹燥衛生，勤洗澡避免因尿頻、尿急、尿失禁誘發炎症和濕疹
2、飲食上少吃辛辣食品
3、大量飲水，每天至少2000毫升左右，多喝水後，排尿次數增多，大量尿液的排出可將泌尿道裏的細菌衝出體外
4、下腹部及膀胱區域進行熱敷，或洗熱水浴及熱水坐浴，目的是加速下泌尿道的血液循環，控製炎症和緩解症狀
5、禁止房事，生病期間停止房事，以免進一步加重病情
尿道綜合征的檢查項目如下：
1.尿常規檢查：在非感染性尿道綜合征無異常發現；在感染性尿道綜合征，僅有少許白細胞，膿細胞，少於5個/高倍視野。
2.無真菌性細菌尿：3次中段尿細菌培養均為陰性，同時排除結核菌，厭氧菌，真菌等致尿路感染的假陰性之可能。
3.衣原體、支原體檢查：在感染性尿道綜合征，有時可尋及膀胱，尿道或鄰近器官感染之病灶，並衣原體，支原體檢查陽性。
4.靜脈尿路造影檢查（IVU）：可初步排除泌尿係結核，腫瘤，結石以及膀胱憩室等疾病。
5.尿道膀胱鏡檢查：了解尿道、膀胱有無感染、腫瘤，有無尿道狹窄及間質性膀胱炎等。
6.尿動力學檢查：表現為膀胱過度活動、膀胱乏力、遠端尿道縮窄和尿道壓力增高等，其中遠端尿道狹窄最常見，而膀胱過度活動症往往是其症狀遷延的病理基礎。
尿道綜合征在飲食上可以多吃利尿性食物，如西瓜、葡萄、菠蘿、芹菜、梨等。此外田螺、玉米、綠豆、蔥白可幫助緩解尿頻、尿急、尿痛等症狀。還有膀胱炎的患者需要多飲水，保持每日至少1500毫升以上的排尿量。但需注意：
1、在飲食上要忌食酸辣刺激性食物，如烈酒、辣椒、原醋、酸味水果等。此外咖啡因能導致膀胱頸收縮而使膀胱產生痙攣性疼痛，故應少喝咖啡。還有要避免食用柑橘，因為柑橘可導致堿性尿的產生，有利於細菌的生長。
2、在服藥期間是嚴禁酒、辣椒、雞、魚、牛肉、蝦、海鮮、鹹菜，佐料隻能是鹽、醋、味精(其它調料不要用)。如果患者飲食控製不好會延長治療時間。
尿道綜合征的西醫治療具體措施如下：
一、一般治療
休息、利尿、熱水坐浴、下腹熱敷、理療及針刺治療等。
二、行為治療
行為治療包括心理治療及生物反饋治療。醫生需與患者進行耐心的交談，使患者對疾病能有正確的認識，並積極配合治療。膀胱功能訓練是行為治療和生物反饋治療的重要內容，通過膀胱訓練能增強神經係統對排尿的控製能力，降低膀胱的敏感性，重建正常的排尿功能，從而緩解或消除尿頻及尿急症狀。具體方法是白天鼓勵多飲水，進行其他勞作或休閑活動，分散對尿意的注意力。主動控製排尿時間，逐漸延長排尿間隔時間，適量配合有關藥物治療。
三、藥物治療
1、α-受體阻滯藥：如萘呱地爾25mg，1次/d，特拉唑嗪2mg，1次/d，或坦洛新(哈樂)0.2mg，1次/d或2次/d口服。
2、解痙鎮痛藥：抗膽堿類藥物如溴丙胺太林(普魯本辛)、山莨菪堿(氫溴酸山莨菪堿)；或選擇性平滑肌鬆弛劑如泌尿靈；毒蕈堿受體阻滯藥如舍尼亭等。
3、鎂離子口服液：可以提高細胞外液鎂離子的濃度，降低逼尿肌的興奮性，使之處於舒張狀態，提高膀胱的順應性。
4、鎮靜及抗抑鬱藥；如阿普唑侖(佳樂定)0.25mg，3次/d或氟西汀(百憂解)20mg，2次/d或3次/d，有抗焦慮、抗抑鬱的協同作用。
5、辣椒辣素或辣椒辣素類似物：2％利多卡因40ml注入膀胱保留30min作為局部麻醉。正常膀胱容量者於排空膀胱後以30ml/min的速度注入濃度為100μmol的辣椒辣素溶液100ml，保留30min。灌注後膀胱容量增加，有局部燒灼痛副作用，療效好，維持時間長，可作為頑固性尿道綜合征的一種有效的治療手段。有研究表明，人類膀胱內存在對辣椒辣素敏感的神經，應用辣椒辣素阻斷傳入神經後，94％的患者症狀得到改善甚至消失。而辣椒辣素類似物辣度為辣椒辣素的1000倍，所需灌注濃度小，具有同樣治療效果，無辣椒辣素的副作用，似乎更值得應用。
6、抗生素：感染仍可能是本症的基本因素，故仍主張在發作時，適當選用抗生素治療，但應避免長時間應用。
7、局部封閉治療：常用封閉藥物如慶大黴素8萬U，地塞米鬆5mg加入2％普魯卡因6ml。可用於膀胱頸及近端尿道封閉，膀胱三角區封閉。
8、雌激素：用於雌激素水平低下者，分全身用藥和局部用藥。常用尼爾雌醇2mg，每半月或1月1次；或己烯雌酚0.5mg，1次/d，連用3周，停藥1周，酌情重複1療程；或替勃龍(利維愛)隔天或每3天半片；或己烯雌酚霜劑，外陰或陰道局部應用等。
四、外科治療
1、尿道擴張：適用於不同程度包括無症狀的尿道梗阻，在尿道黏膜麻醉下施行，每周1次，尿道擴張器號碼應逐漸增大至F36～F42，多數患者症狀得到改善。
2、尿道鬆解術：尿道狹窄經擴張術無效者，可在局麻下行此術，待傷口愈合後可配合使用每兩周1次的尿道擴張。手術去除尿道陰道膈間遠端1/2彈力組織索或多處環形切開彈力組織索，可降低尿道阻力。
3、尿道口、處女膜變異矯治：
（1）小陰唇融合：小陰唇分離術。
（2）尿道外口呈瓣形、堤壩形者行堤壩或瓣切除術；處女膜傘應予切除。
（3）尿道處女膜融合型：有多種手術方式，如尿道外口成形術、陰道口前緣後移術、尿道前庭移植術等。前兩種術式設計似乎更合理，效果也較好。適應證：症狀與性交關係密切的尿道處女膜融合症患者最適合此手術治療；經各種治療無效者，盡管症狀與性生活關係不大，但也可以考慮手術治療。婚後未育者暫不宜手術治療，以免日後因分娩創傷而影響手術效果。手術要求達到尿道口和遠端尿道平滑，延長尿道口-陰道口間距(1cm以上)，效果較好，且性生活滿意度提高。