不耐酸的鱗狀上皮遭到損害，耐酸的柱狀上皮再生並逐漸向上蔓延累及食管下段，潰瘍可穿透食管壁，使縱隔組織纖維化和發生淋巴結炎，如果血管受到破壞則引起出血，縱隔和胸膜可有化膿性病變，鏡檢粘膜內層具有非典型柱狀上皮的異常和增生。
除了一般症狀外，還會引起其他疾病，本病可並發潰瘍穿孔或出血。所以一經發現，需積極治療，平時也應做好預防措施。應引起臨床醫生和患者的高度重視。
本病多見於中年或老年，主要表現為食冷，熱食物，特別是酸性食物後，或取臥位時，出現反複發作的下段胸骨後疼痛和燒灼感，疼痛可放射至頸部，肩胛部或雙臂，晚期可有咽下困難，嘔吐，嘔血，黑糞等，此外，可並發潰瘍穿孔或出血。
積極預防反流性食管炎如果血管受到破壞則引起出血，縱隔和胸膜可有化膿性病變，鏡檢粘膜內層具有非典型柱狀上皮的異常和增生
1、X線檢查可見食管壁呈孤立性火山口狀潰瘍或龕影，距火山口的遠端皺褶消失或不典型的皺褶，病變上方痙攣，由於水腫而狹窄。
2、食管鏡檢查可見火山口狀潰瘍灶，粘膜皺褶欠清，炎症水腫，出血，白斑，脫落細胞檢查無惡性細胞。
一、巴瑞特綜合征食療方
1、痰濕內阻者，宜祛濕化痰、理氣止咳，可用陳皮法夏薏苡仁粥；
2、脾虛痰濕阻滯者，宜健脾祛濕，可用薏苡仁淮山龜肉湯或薏苡仁菱角田七瘦肉湯；
3、脾胃虛寒者，宜健脾和胃，可用砂仁魚鰾瘦肉羹或粟米淮山猴頭菇水鴨湯；
4、氣滯血瘀者，宜活血祛瘀、通絡止痛，可用田七桃仁瘦肉湯；
5、因病虛損者，宜補腎填精、健脾養胃，可用冬蟲草燉鴨肉；
6、外科手術後氣血兩虛、創口難以愈合者，宜益氣養血、補虛生肌，可用人參黃芪燉生魚。臨床報告顯示，在食管癌手術全期護理中，服用黃芪可明顯增強機體免疫力；
7、放射治療後陰津虧損者，宜清胃止嘔、益氣祛痰，可用蘆根洋參柿霜粥、無花果敗醬草瘦肉湯或蛇莓龍葵半枝蓮瘦肉湯；
8、手術、放射治療或化學治療後身體虧虛者，宜健脾益氣、滋陰補腎，可用淮杞燉鱉。
二、巴瑞特綜合征吃什麼食物對身體好
1、多吃軟食。食用易於消化的食品，盡量減少對胃粘膜的刺激，細嚼慢咽，讓牙齒把食物完全磨碎使食物能與胃液充分混合。
2、多攝入富含B族維生素的食物。如動物肝髒、瘦肉、魚類、新鮮水果、綠色蔬菜、奶類、豆類等，有利於促進損傷咽部的修複，並消除呼吸道黏膜的炎症。
3、吃富含膠原蛋白和彈性蛋白的食物。如豬蹄、豬皮、蹄筋、魚類、豆類、海產品等。
三、巴瑞特綜合征最好不要吃什麼食物
1、平時應少吃或忌食高脂肪的飲食，戒煙、戒酒，尤其不飲烈性酒。少吃檸檬汁、咖啡、巧克力、柑橘類水果、西紅柿、胡椒粉等，還應避免餐後平臥和睡前進食。
2、少吃或不吃煎炸、辛辣刺激性食物，如：油條、麻團、炸糕、辣椒、大蒜、胡椒粉等。
一、巴瑞特綜合征中醫治療方法
1、中藥治療：
（1）痰濕內阻者，症見吞咽梗阻，進食不暢，胸隔痞悶，伴有胸痛隱隱，疲倦乏力，納呆，大便溏，舌質淡胖，苔白膩，脈滑。治宜健脾理氣，燥濕化痰。方以旋覆代赫湯加減，藥如旋覆花、代赫石、黨參、法半夏、蘇梗、浙貝、山慈菇、八月劄、生南星、生苡仁、守宮、瓜萎皮等。
（2）氣滯血瘀者，症見進食梗阻，食不得下，甚至水飲難下，食後即吐，吐物如豆汁，胸隔疼痛或痛連肩背，便如羊屎，形體消瘦，麵色晦暗，肌膚甲錯，舌質暗紅，或有瘀點瘀斑，苔薄黃，脈澀或弦細。治宜理氣化痰，活血祛瘀。方以通幽湯化裁，藥如桃仁、紅花、當歸、生地、丹參、田七、八月劄、威靈仙、急性子、五靈脂、橘紅、甘草等。
（3）津虧血枯者，症見進食梗澀難下，甚至水飲難咽，形體消瘦，口幹咽燥，五心煩熱，大便秘結，舌質紅幹，或帶裂紋，無苔或薄黃苔，脈弦細。治宜養陰生津，補血潤燥。方以百合固金湯加減，藥如百合、玄參、麥冬、生地、熟地、白芍、川貝、桔梗、甘草、野葡萄藤、守宮、山海螺等。
（4）晚期食管癌氣虛陽微者，症見飲食難下，泛吐清涎，形體消瘦，麵色泛白，形寒肢冷，麵浮足腫，舌質暗淡，苔薄白，脈沉細。治宜健脾益氣，溫陽散結。方以補氣運脾湯加減，藥如黨參、黃芪、白術、茯苓、法夏、陳皮、桂枝、八月劄、全蟲、山慈菇、白芍、熟附子等。
（5）放射治療後熱盛津傷絡阻者，症見皮膚潮紅、瘙癢、滲液破潰，胸痛幹咳，吞咽疼痛，進食梗阻加重，納呆，口幹舌燥，小便短赤，大便幹結，舌暗紅，苔黃，脈細數。治宜清熱解毒，益氣養陰，活血化瘀。藥如黃芪、北沙參、石斛、花粉、銀花、梔子、瓜蔞、竹茹、陳皮、茯苓、紅花、桃仁、焦六曲、雞內金、女貞子等。
（6）化學治療後脾腎虧虛、胃失和降者，症見疲倦乏力，脘痞惡心欲吐，便溏或腹瀉，納呆，舌淡，苔薄，脈細。治宜健脾補腎，和胃調中。藥如黃芪、太子參、雞血藤、白術、茯苓、薑半夏、陳皮、木香、柿蒂、雞內金、焦六曲、澤瀉、女貞子、枸杞子、生薑、大棗等。
2、針灸治療：針刺天鼎、天突、膻中以下氣寬隔除痰，上脘、中脘、下脘和降胃氣，內關、足三裏健脾胃以資氣血生化之源。病灶在食管上段加期門、不容等，痰多便秘加豐隆、大腸俞，胸痛引背加心俞及阿是穴，進食困難重刺內關，胸脘痞悶加大陵。均用平補平瀉法。
3、外敷療法：軟堅散結膏由歸尾、栝萎、川薑活、白芷、元明粉、木鱉子、三棱、白芨、白薇、生地、黃芪、天花粉、川烏等20餘種藥物組成，以麻油、廣丹熬製成膏藥，攤在布上均勻撒上散堅丹（明礬、冰片、樟腦等），貼於病灶對應處，也可貼於腫大的淋巴結處，具止痛功效。耳針：取穴腎、胃、食道、神門、內分泌，用於食管癌吞咽梗阻，飲食不下。
二、巴瑞特綜合征西醫治療方法
1、藥物治療：可應用粘膜保護劑硫糖鋁，同時給予H2-受體阻滯劑或質子泵抑製劑。促動力藥普瑞博思對防止食管反流有一定療效，每次5～10mg，每日3次。
2、手術治療：常需外科手術。