陰莖根部起水皰可能清潔衛生不到位、生殖器皰疹、包皮龜頭炎等原因所造成。需要及時在醫生的指導下進行診治，有利於陰莖部位恢複健康。
1、清潔衛生不到位：沒有做好陰莖部位清潔衛生時，容易導致陰莖部位出現不適症狀發生，一般可以通過及時做好陰莖部位清潔護理改善。
2、生殖器皰疹：在感染單純皰疹病毒之後容易使生殖器官出現糜爛、水皰、瘙癢等不適。通常需要遵照醫囑使用藥物進行治療，比如伐昔洛韋或者阿昔洛韋。
3、包皮龜頭炎：當包皮龜頭出現炎症刺激時，可能會導致陰莖根部出現異常。一般需要在醫生的指導下使用紅黴素軟膏或者酮康唑軟膏。
除上述之外，還可能是尖銳濕疣等因素引起，需要就醫治療，使身體康複。
