1.嚴格控製傳染源
（1）管理患者發現疑似或確診患者，應立即按緊急電話和網絡報告疫情，城市不得超過2小時，農村不得超過6小時。同時將患者嚴密隔離，禁止探視及患者互相往來。患者排泄物應徹底消毒，患者死亡應火葬或深埋。對於肺鼠疫患者要進行嚴格的隔離以防空氣傳播。
各型鼠疫患者應分別隔離，肺鼠疫患者應單獨一室。不能與其他鼠疫患者同住一室。腺鼠疫隔離至淋巴結腫完全消散後再觀察7天，肺鼠疫要隔離至痰培養6次陰性。鼠疫接觸者應檢疫9天，對曾接受預防接種者，檢疫期應延至12天。
（2）消滅動物傳染源對自然疫源地鼠間鼠疫進行疫情監測，控製鼠間鼠疫，廣泛開展滅鼠愛國衛生運動。
2.切斷傳播途徑
（1）消滅跳蚤患者的身上及衣物都要噴撒安全有效的殺蟲劑殺滅跳蚤，滅蚤必須徹底，對貓、狗，家畜等也要噴藥。
（2）加強交通及國鏡檢疫對來自疫源地的外國船隻、車輛、飛機等均應進行嚴格的國境衛生檢疫，實施滅鼠、滅蚤消毒，對乘客進行隔離留檢。
3.保護易感者
（1）保護接觸者在流行時應避免接觸蚤，腺鼠疫患者的接觸者應用適當的殺蟲劑進行滅蚤，所有的接觸者是否需要用抗生素進行預防服藥都要進行評估，與疑似或確診的肺鼠疫患者的接觸者後要用四環素或氯黴素，分4次服用，從最後接觸的時間起連服一周。也可口服磺胺嘧啶；另外，環丙沙星對鼠疫杆菌也是敏感的。
（2）預防接種自鼠間開始流行時，對疫區及其周圍的居民、進入疫區的工作人員，均應進行預防接種。常用為EV無毒株幹燥活菌苗，皮膚劃痕法接種，即2滴菌液，相距3～4厘米。2周後可獲免疫。目前的疫苗仍不能對腺鼠疫和肺鼠疫產生長久的免疫保護，因此，一般每年接種一次，必要時6個月後再接種一次。
（3）醫務人員保護個人防護進入疫區的醫務人員，必須接種菌苗，兩周後方能進入疫區。工作時必須著防護服，戴口罩、帽子、手套、眼鏡、穿膠鞋及隔離衣。
