隱匿性遞質是由於在身體產生物質的化學結構上跟病理性遞質的物質很類似，可是隱匿性遞質的生理學作用相對性於病理性遞質而言又較為弱，因此 就稱做為隱匿性遞質，大多數在產生肝功能異常時候出現這類狀況。假遞質釋放出來後造成中樞神經係統一些位置(如脊髓多孔結構上漲興奮係統)作用產生阻礙，使人的大腦產生深層抑止而昏迷。
隱匿性遞質理論是肝性腦病的一個發病機製基本原理，它是屬於遞質的轉變這一類，一切正常是體液調節和抑製型遞質，維持生理學均衡，體液調節的遞質有茶酚胺中的膽堿、去甲腎上腺激素、乙酰膽堿、磷酸，及其天冬氨酸等，食材中的脂環包含碳水化合物，例如色氨酸、苯丙氨酸等常常菌脫羧酶的功效各自轉換為酪胺和苯乙胺。
假如肝髒對酪胺和苯乙胺的消除產生阻礙，這二種丙烯胺能夠進到腦組織在中樞神經羥化酶的功效各自β羥酪胺和苯乙醇胺。
二者的化學結構與一切正常遞質去甲腎上腺激素類似，可是不能夠傳送神經衝動或功效太弱，因而被稱作隱匿性遞質，當隱匿性遞質被大腦神經攝入並替代了神經遞質中的一切正常遞質，則神經傳導產生阻礙。
在腸道內，一部分碳水化合物經腸菌的碳水化合物脫羧酶功效而產生丙烯胺，如苯丙氨酸及色氨酸脫羧產生苯乙胺及酪胺，一切正常狀況下可被肝內單胺氧化酶溶解而消除。肝功能不全時，因為肝內單胺氧化酶特異性減少或門體側支循環的產生，因此芳香胺類立即經體循環入腦，經腦內非特異羥化酶功效，因此苯乙胺羥化而轉化成苯乙醇胺，酪胺經羥化而轉化成鱒胺(β-羥酪胺)。因為苯乙醇胺及 胺與兒茶酚胺遞質(膽堿、去甲腎上腺激素)構造類似，又不可以一切正常地傳送欲望，故稱假遞質。
假遞質釋放出來後造成中樞神經係統一些位置(如脊髓多孔結構上漲興奮係統)作用產生阻礙，使人的大腦產生深層抑止而昏迷。黑質、紋狀體通道中的膽堿被假遞質替代後，使乙酰膽堿的功效占上風，因此出現撲翼樣振顫。自然，假遞質理論也不可以表述所有肝性腦病的產生體製。
