懷孕寶寶腦積水的原因可能是因為胚胎發育異常，一般和懷孕期間外界因素、母體因素、不恰當用藥等因素有關，有必要的情況下要配合醫生終止妊娠。
1、環境因素：在懷孕期間，如果長時間的在汙染的環境中，可能會導致胚胎發育異常，容易引起腦積水的可能性增大，在懷孕期間避免在汙染的環境中，能夠預防腦積水。
2、母體因素：懷孕寶寶腦積水，有可能是因為母體存在妊娠期糖尿病、高血壓等疾病，避免出現慢性疾病，能夠預防寶寶腦積水。
3、不恰當用藥因素：在懷孕期間不恰當的用藥引起了胚胎發育異常，也可能會導致寶寶腦積水，孕期需要謹遵醫囑用藥，能夠預防寶寶腦積水。
除了以上原因以外，也有可能是因為孕期病毒感染、真菌感染等，要及早的做治療，可以降低腦積水的可能性。
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