1.調整飲食
詳細了解病人的飲食習慣及其與症狀的關係，避免敏感食物，避免過量的脂肪及刺激性食物如咖啡、濃茶、酒精等，並減少產氣食物(奶製品，大豆，扁豆等)的攝取。高纖維素食物(如麩糠)可刺激結腸運動，對改善便秘有明顯效果。
2.心理和行為治療
對病人進行耐心的解釋工作，具體包括心理治療，生物反饋療法等，對於有失眠，焦慮等症狀者，可適當予以鎮靜藥。
3.藥物治療
(1)解痙劑目前使用較為普遍的是選擇性腸道平滑肌鈣離子通道拮抗劑，或離子通道調節劑。抗膽堿能藥如阿托品、顛茄、莨菪堿類也能改善腹痛症狀，但需注意不良反應。
(2)通便劑便秘可使用導瀉藥，可試用容積性瀉劑如甲基纖維素和滲透性輕瀉劑如聚乙二醇、乳果糖等。刺激性瀉劑應慎用。
(3)止瀉劑如洛呱丁胺或複方苯乙呱啶等，可改善腹瀉，需注意便秘、腹脹等不良反應。輕症者可選用八麵體蒙脫石等吸附劑。
(4)促動力劑適用於有腹脹和便秘型患者。常用的有西沙比利或莫沙必利等。
(5)內髒止痛劑生長抑素及其類似物如奧曲肽，具有緩解軀體和內髒疼痛的作用。5-HT3受體阻滯劑如阿洛司瓊，能改善腹瀉型患者的腹痛及大便次數，可引起缺血性結腸炎等不良反應，使用時需注意。5-HT4受體的部分激動劑因其存在增加心血管缺血事件的風險，已被停止使用。
