急性腦膜炎在通過治療以後，是會有後遺症的，雖然經過一段時間的治療，患者仍然會有不同程度的肢體障礙、感到麻痹、吃東西困難等等的症狀，這些症狀都是很常見的，也不是每個患者治療後都會產生後遺症，但是這些後遺症也可以慢慢恢複。
能否得到最佳的恢複在於初發病後一次性治愈，若稍留有症狀多會遲發腦病導致更嚴重的後遺症。病毒性腦炎發病後西醫用激素蛋白治療可控病繼發更嚴重的損害腦神經，控病後神經不能恢複軾能的原因是受炎症侵襲的神經仍出於麻痹不全狀態。
能否恢複在於及早的治療恢複神經功能才能早日康複。治療不當延誤治療受累神經會因缺血進間過久而遲發變性壞死。恢複無望。故能否恢複在於控病後的及早正確治療。治療方案：中藥營養神經增強改善受損神經微循環的血運，使受累麻痹不全的神經得到充分的血供預防繼發性缺血性受累神變性。並采用神經再生之藥興奮脊髓激活麻痹休克的神經獲得各種神經功能的改善恢複。需指導請發發病時和最近的磁共震和腦脊液檢驗單再次聯係。
急性腦炎（腦膜炎）等腦科急性病症所造成的後遺症目前還沒有什麼好的或特別有效的治療方法，所稱的治療也多指那些康複性治療或鍛煉，並且需要很長的康複期才可能稍有效果，所以應該要堅持下去。
