尿道感染類的炎症治療大多數以抗生素的醫治為主，絕大多數患者都可痊愈。在施以抗生素治療前，通常會進行尿液檢查，用抗生素持續治療4至7天，症狀就會明顯緩解。對於少數會出現反複性泌尿道感染的患者，一定要再做尿液的細菌培養，找出致病菌種，避免再用已出現抗藥性的抗生素，才能一舉將頑強的細菌殲滅。
膀胱發炎，通常口服抗生素4至7天即可痊愈；若進展到急性的腎盂腎炎，就需住院接受靜脈注射抗生素的治療，直到完全沒有發燒且持續48小時後，才改口服抗生素，整個抗生素療程為10-14天。再者，臨床上常見患者因擔心用多了抗生素對身體不好，隻要症狀稍已緩解，就自行停藥，殊不知治療天數不足、治療劑量不夠，泌尿道裏麵的細菌未被殺光，少數僥倖存活下來的細菌，就會對那種抗生素產生抗藥性，將來再用這種抗生素時，就失去效果，隻好求助第二線、甚至第三線的抗生素。
像是ESBL這種具抗藥性的大腸杆菌，由於已出現多重性菌株，目前隻有一、兩種針劑型抗生素可用，相當棘手。萬一所有抗生素全都無效，再也找不到足以殺死細菌的武器，最後唯有舉起白旗投降的份。所以服用抗生素千萬不要自行停藥，應遵從用藥指示。治療期間，除了抗生素的藥物治療外，病患應盡量攝取水份及富含維生素C的水果，保持良好衛生習慣。
