抗生素藥物治療隻能暫時控製感染，減輕症狀，不能祛除內部膽脂瘤病灶，故藥物治療隻是作為手術治療的輔助和準備。
治療膽脂瘤型中耳炎的手術多種多樣，但可歸納為以下5種類型。正確選擇手術方法，不僅能清除膽脂瘤，防止複發，還能保全或提高聽力，提高生活質量。
1.開放術腔的鼓室乳突根治術
去除外耳道後壁，使外耳道和乳突腔成為一個完整的腔。包括乳突根治術和改良乳突根治術。改良乳突根治術是將乳突根治術與鼓室成形術相結合，保持或改善原有的實用聽力。開放術式導致外耳道後壁的缺失，一則影響美觀，二則影響生活質量，如不能遊泳，耳道自潔差。但本術式可以充分暴露，利於去除病變，減少膽脂瘤複發。
2.完壁式鼓室成型乳突根治術
完壁式鼓室成型乳突根治術由Jansen創用，由前、後聯合進路鼓室切開手術治療膽脂瘤和中耳慢性感染。由於這種手術能切除範圍很廣泛的膽脂瘤，並盡可能地保留有利於聽骨鏈重建的正常解剖結構;由於沒有開放的乳突術腔，因此不需要定期清理痂皮;患者外耳道感染的機會小，並且可參加遊泳活動，減少了因佩帶助聽器而發生的外耳道感染;外耳道美觀;消除了開放式手術所帶來的溫度變化刺激半規管而引起眩暈。
3.保留骨橋的乳突根治術
由Paparella和Jung於1983年設計出這種手術保留了開放式和完壁式手術各自的優點。利於清除病灶，還可一期重建聽力，手術切除上鼓室外側壁的前分骨質切除，切除外耳道後壁骨質，充分暴露上鼓室和鐙骨周圍結構。清除上中鼓室，磨乳突腔，保骨橋，聽骨鏈重建和鼓膜修補，修補鼓膜的筋膜覆蓋於骨橋和乳突腔內端，經外耳道成形後。由於保留了骨橋，保持較大的鼓室腔，有利於聽力重建。由於無麵神經隱窩切開。
4.重建外耳道的乳突根治術
Wullstein開始認識到這種方法的優點，並利用骨瓣成形修複外耳道後壁。Dornhoffer也報道一種逆向乳突切除、外耳道重建手術方法，由於傳統的開放式和完壁式手術治療膽脂瘤時均有各自一定局限，部分外耳道切除並一期外耳道重建術的概念遂被提出。
5.中耳乳突內鏡手術
近年來國內外均陸續有相關報道。由於完壁式鼓室乳突根治術容易發生病灶殘留，利用內鏡可以看到手術顯微鏡不容易看清的部位，如上鼓室、鼓室竇、咽鼓管等。Thomassin等曾經報道，使用內鏡行原發性獲得性膽脂瘤手術，病變的殘留發生率由48%降低到6%。
