1.消化道疾病
消化道疾病史造成便血最普遍也是最主要的原因。消化道疾病比較普遍，比如食管的靜脈曲張、腸胃潰瘍病和急性胃炎等，而胃黏膜脫垂、腸套疊絞窄性腸梗阻和腸息肉也會造成便血。
2.血液疾病
剛出生的寶寶如果患有血友病、白血病和再生障礙性貧血、血小板減少等病症也會有便血現象。
3.其他感染性疾病
一些感染性疾病，如敗血症和傷寒。如果寶寶在產婦生產過程中吸入產道中的血，也會引起便血。
4.食物、藥物影響
有的食品或藥物也會造成小朋友的糞便顏色出現異常，這種變化和便血極為類似，差距較小，不易分辨。如果一次吃了過量的西瓜或西紅柿的話，糞便就會變為紅色；患有貧血症的寶寶如果吃了過量的補鐵藥物後，大便的顏色就會變黑；而寶寶如果吃了太多的動物血的話，糞便的顏色同樣會變為黑色，但這些並不屬於便血的病症。
5.全身性、中毒性疾病
（1）寄生蟲病：一些寄生蟲病和傷寒，同樣會對消化道造成傷害。比如斑疹傷寒、鉤端螺旋體病、鉤蟲病和敗血症等。
（2）中毒：如果寶寶中毒的話也會有便血症狀出現，比如藥物中毒、食物中毒和化學性中毒等。
（3）血管疾病：比如遺傳性和出血性毛細血管擴張同樣會導致便血。
