1、先天性
由於髓管殘留或骶尾縫發育畸形導致皮膚的包涵物，但與嬰兒的中線位肛後淺凹部位很少找到藏毛疾病的前驅病變，而在成年人確多見。
2、後天性
認為竇和囊腫是由於損傷，手術，異物刺激和慢性感染引起的肉芽腫疾病，近來證實由外倍進入的毛發是主要病因，臀間裂有負吸引作用，可使脫落的毛發向皮下穿透，裂內毛發過多過長，毛頂部有濾過和浸軟毛膚作用，毛發穿入皮膚，形成短道，以後加深成竇，毛根脫落到竇內也可使毛幹穿透，在發病過程中可見運動改變，但隻有一半病例可發現毛發，此病多見於多毛平，皮脂過度活動，臀間裂過深和臀部常受傷的病人，汽車司機骶尾部皮膚常受長期顛波，損傷，可使皮脂腺組織和碎屑存積於囊內，引起炎症，美國陸軍發生這種病較多，稱為吉普病，常見的病菌有厭氧菌，葡萄球菌，鏈球菌和大腸杆菌，Rainsbury及Southan分析了靜止的藏毛疾病，單個細菌不到半數，而厭氧菌占58％，奇怪的是葡萄球菌不常見，多數需氧菌為革蘭陰性細菌。
癌腫發生於藏毛竇少見，Phipshen(1981)複習文獻僅有32例，病變多為分化良好鱗狀細胞癌，傷口改變應引起疑有癌變，如潰瘍易破，生長很快，出轎及黴菌樣邊緣，廣泛切除應首選，由於傷口廣泛應用用植皮或皮瓣治療，腹股淋巴結腫大應作活檢以除外有否轉移，若有轉移則預後不佳，文獻報告5年生存率為51％，複發率點50％，在初診時發現腹股淋巴結有轉移占14％。
藏毛囊腫無繼發感染時可無症狀，通常主要和首發症狀是在骶尾部發生急性膿腫，和其他部位軟組織膿腫相似，局部有紅，腫，熱，痛等急性炎症，多自動穿破流出膿汁或經外科手術引流後炎症消退，引流口可以完全閉合，但多數表現為反複發作或經常流水而形成竇道或瘺管。
原發的管道多在骶尾部中線，其內壁是鱗狀上皮，管道在皮下延伸一段距離，一般長約2～3cm，可能有小膿腔，或從原發管道有小的支管分出，膿腔和支管內壁多為肉芽組織，常見到有與周圍皮膚不相連的毛發從竇口長出，藏毛腔位於中線，多數呈直線方位，長約1～15cm，腔壁由堅韌纖維組織形成，繼發管道可以從主腔分出至皮下組織，常有分泌溢於皮膚表麵，多自旁側頭向延伸，少數亦可向肛門延伸，從而易與常見的肛周瘺管相混淆。
藏毛竇或藏毛囊腫的主要診斷標誌是骶尾部急性膿腫或有分泌的慢性竇道，局部表現有疼痛，壓痛和炎症浸潤，檢查時在中線位見到藏毛腔。
1、預防感染，加強鍛煉身體，增強體質，提高自身免疫功能，生活規律
2、保持良好的心態非常重要，保持心情舒暢，有樂觀、豁達的精神、堅強戰勝疾病的信心不要恐懼，隻有這樣，才能調動人的主觀能動性，提高機體的免疫功能
3、注意皮膚衛生，加強身體鍛煉，增進皮膚的抵抗力
組織病理囊腫位於真皮或皮下組織，囊壁表皮，囊壁內可見到毛幹，囊腫周圍可見淋巴、組織細胞及中性粒細胞混合炎症細胞浸潤，可見異物巨細胞和肉芽組織。
藏毛囊腫最好不要吃哪些食物：
辛辣食物有促進血液循環，助長體內濕熱的作用，癤、癰患者體質多濕多熱，辛辣食物入口後會使火上澆油，使炎症擴散，當忌辣椒、辣油、咖喱、川椒、韭菜、蒜苗、芥末等辛辣食物。
手術治療：
急性膿腫形成時，治療方法很簡單，即在局麻下十字切開引流，切口選在波動或壓痛最明顯處，避開正中線。抗生素不能替代外科引流。對膿腫伴有蜂窩織炎，或患者伴有糖尿病，血管性心髒病或免疫缺陷等時，可加用抗生素治療。術後經常檢查創口是否愈合，剃去周圍的毛發，用探針輕柔地探查竇腔，或有可能把一簇毛拉出，這簇毛作為異物而使感染永存。經過以上治療，有些病人創麵可能一期愈合，但多數在1～2月後仍不愈合，呈慢性反複發作，這樣就需要進行藏毛竇的根治性手術治療。
對慢性藏毛竇的根治性手術，沒有一種方法可以證實是完全成功的。過去曾有用過廣泛切除手術進行治療，實踐證明創口愈合緩慢，使病人蒙受不必要的痛苦和損失。目前多采用比較保守的手術，僅切除病變組織而盡量保留正常的皮膚和皮下組織。優先選擇的方法是袋形手術，即切除竇道壁的表麵部份和上蓋皮膚，縫合竇道殘腔與皮膚的切緣，這樣可以縮小創口以促進愈合。對側支竇道需分別切至末端，同樣袋形化，一般用羊腸線或可吸收的人造縫線。仔細的術後處理頗為重要，常是開放性藏毛竇愈合的關鍵。用細紗布敷料，填塞在竇道上，一定要使創口邊緣分開，愈保持平整愈好。用帶子固定敷料代替膠布以減少皮膚刺激，注意局部衛生，創口發現有架橋時，應立即用棉簽分開。如周圍有過多毛發，應經常剃毛。過多的肉芽生長可予刮除或硝酸銀燒灼，定期隨訪直至創口完全愈合。偶有創口經久不愈，可經常抓刮，用水衝洗，以保持清潔。某些病例用加壓包紮，可能會促進創口愈合。
對複發性藏毛竇，不必作廣泛切除，可作類似原手術的袋形手術，簡單而同樣有效。