超聲波理療往往是選擇赫茲800赫茲到1000赫茲的頻率是的聲波進行疾病治療。這種頻率的超聲波往往不會吃人的聽覺產生反應，但是可以對於一些疾病進行治療。目前超聲波理療已經應用於癌症的治療，並且還可以用於某些泌尿係統結石疾病的碎石治療。並且隨著醫療技術的不斷發展，超聲波理療的應用範圍還在不斷擴展。
超聲波理療的具體機製可以是機械性的，也可以是溫熱性的。機械作用是超聲波的一種基本的原發的作用。超聲波在介質內傳播過程中介質質點交替壓縮與伸張形成交變聲壓，不僅可使介質質點受到交變壓力（在治療劑量下，每一細胞均受4－8mg壓力變化影響）及獲得巨大加速度而劇烈運動，相互摩擦，而且能使組織細胞產生容積和運動的變化。
超聲波理療的溫熱作用主要是利用超聲波來使得身體產生熱量，有些人甚至稱為“超聲透熱療法”。超聲波在機體內熱的形成，主要是組織吸收聲能的結果。
之所以可以通過超聲波理療來治療疾病，這是因為在超聲波的溫熱作用或者是機械作用下，身體內部氫離子的濃度可能發生改變，並且還可以使得身體酶活性受到影響，並且通過這種理療方式可以進一步影響到身體蛋白質合成，還可以刺激身體組織細胞不斷生長。這種理療方式另外一個作用是使得身體內部氧化還原反應得到加強。
