胃間質瘤一般和遺傳因素、環境因素、免疫因素等都有一定關係，具體原因不能完全確定，因為每個人的情況會不一樣，到醫院檢查後才能確定。
1、遺傳因素：胃間質瘤和遺傳是有很大關係的，如果父母當中或者家族當中患有此疾病，子女遺傳的幾率會比較高，後期要及時到醫院檢查和治療。
2、環境因素：如果在生活當中長時間處於不良的環境下，沒有做好環境的清潔衛生，以及長期處於精神緊張和壓力大的狀態下，還有長期熬夜等等也都會引起這種疾病。
3、免疫因素：當身體處於免疫力低下的狀態，又受到了一些不良因素的感染，也會引起此疾病，需要及時選擇。
除了以上這些原因之外，也有一部分患者是神經體液調節的問題或飲食因素引起。
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