一、身份不同
α-亞麻酸是DHA的母體。進入人體後，在酶的催化下，轉化成EPA和DHA。
二、性質不同
醫學上稱α-亞麻酸為人體必需脂肪酸，而DHA不是。人體必需脂肪酸對人體生命特別重要，而人體自身不能合成，必需從外界補充。由此可見，兩者對人體的重要性和補充的必要性存在很大差異。
三、來源不同
α-亞麻酸多來自植物油，不含任何膽固醇，且純度高，而DHA是從深海動物主要是深海魚油中提取，是深海動物吃含有α-亞麻酸的海藻後代謝成含有DHA和EPA的脂肪，然後經過化學方法提取而成的。目前市場上DHA產品純度不高，且含有膽固醇和大量飽和脂肪酸，同時受海洋汙染的影響，含有重金屬汞。
四、作用不同
DHA是大腦細胞的重要部分，但單獨使用作用單一，又由於個體的差異，人體所需DHA的量有所不同，直接補充DHA有可能幹擾人體的本身固有的代謝過程。而α-亞麻酸通過肝髒代謝成EPA和DHA，其量可根據人體代謝需要由肝髒調整，因而不會幹擾人體固有的代謝過程。此外，其本身具有降血脂血壓促進智力發育等諸多功能，對人體的好處遠遠大於單獨補充DHA。更重要的是，EPA其免疫調節劑和炎症反應的作用，對人體是不可或缺的，尤其是孕產階段。美國妊娠協會指出：適量的EPA可以保護孕婦的心髒，有助於預防陣痛和分娩，降低先兆子癇的風險，增加嬰兒的出生體重。
五、吸收率不同
α-亞麻酸是植物油脂，與人體親和力強，易於吸收，而DHA屬動物肝髒，人體不易吸收。
六、使用人群不同
α-亞麻酸適用於所有人群，而有些DHA產品孕產婦不宜。
