自閉症與一些疾病還是會有相似之處的，所以在生活中，需要懂得到底什麼是自閉症，一般有下麵的辨別方法：
自閉症與多動症
多動症兒童主要表現為行為興奮、多動、孤僻、不合群，上課注意力不集中，作業不認真。但他們隨著年齡的增長和教育幹預，症狀會漸漸減輕消失。自閉症兒童：有多動現象占36%-47%，不超過半數，而呆板動作、刻板的語言、強迫性、儀式性動作的出現率卻高達88%以上，明顯高於半數，而且這些症狀多數不隨年齡增長而改變，采取有效的教育幹預可以部分緩解。
自閉症與聽覺障礙
自閉症兒童一般無聽力損失，發音器官功能正常，也可以說話，但主要是交往障礙，缺乏交往欲望。聽覺障礙兒童由於有聽力損失，影響了說話的能力，但是他們有交往欲望，經過康複後，能結合手語進行正常的交往。個別聽力殘疾兒童，因聽覺障礙又沒經過有效的康複，長期形成性格內向，往往不願交往，但與自閉症兒童有本質的區別。
自閉症與精神障礙
有很多人將自閉症與兒童精神分裂症混淆，二者的症狀也確實有很多相似之處，如眼神不謀合，興趣範圍狹小等，但是二者在存在性別差異的不同。自閉症男、女孩兒比例為4：1，兒童精神分裂症男女相當;症狀表現的不同，精神分裂症常有幻聽、妄想症狀，而自閉症很少出現。
自閉症與智力落後
智力殘疾(一般智商70)自閉症兒童交往溝通行為模式等與智力殘疾兒童有本質的不同，主要是缺乏意願，沉溺於自我世界。
自閉症與Rett綜合症
Rett綜合征僅見於女孩，患兒在早期發育正常，在大約6-24個月左右起病，病情發展通常經曆四個階段，早期起病停滯階段(6-18月)、快速倒退階段(1-4歲)、假性停滯階段(學前-學齡早期)和晚期運動衰退階段(5-15歲)。在第一和第二階段會出現與自閉症同樣的表現，如語言功能的喪失、特征性的手部刻板"洗手"動作、智力顯著倒退和過度通氣等。但是該病患兒在第三四階段表現有較為明顯的神經係統症狀和體征，例如肌張力減低、軀幹共濟失調和失用、脊柱側突和後突，重症患兒出現強直狀態，多數病例伴有癲癇發作。據此可與自閉症鑒別。
自閉症與阿斯伯格綜合征
阿斯伯格綜合征患兒有社會交流障礙和重複刻板行為，但是在語言和認知能力方麵發育正常，而且多數患兒可能在認知的某些方麵表現為超常，尤其是對文字、地圖、統計表等記憶方麵;動作笨拙是該病的一個特征，在學校難於和同學建立友誼關係，通常僅僅在學齡期才被發現。較容易與高功能孤獨症混淆，鑒別要點是高功能孤獨症兒童存在語言發育遲緩，而阿斯伯格綜合征患兒沒有明顯的語言發育落後現象。(新的DSM將阿斯伯格綜合征取消，並歸入自閉症譜係障礙中，僅對自閉症譜係障礙的程度進行分級。)
