化膿性扁桃體炎必須足量抗菌素治療，這是治療的原則性問題。化膿性扁桃體有效抗菌素治療三天後會見效，例如青黴素、頭孢曲鬆或頭孢噻吩及左氧氟沙星等，其中使用左氧氟沙星最方便，一次0.4克，一般是0.2克一瓶，兩瓶連用，最多1個半小時就搞定，但18歲以下是禁用的，因為會抑製骨骼發育。
扁桃體炎是指位於咽部的扁桃體的非特異性炎症，由於病毒或細菌感染引起，由病毒所致者常常是急性病毒性上呼吸道感染的一部分，而由細菌感染所致者則稱為化膿性扁桃體炎，其症狀、治療、預後與普通病毒性上呼吸道感染不全相同。
急性化膿性扁桃體炎起病急，高熱，咽痛明顯，吞咽時尤甚，檢查可見咽部充血，腫大的扁桃體上麵有黃白色膿點或膿苔，頸部淋巴結腫大。急性化膿性扁桃體炎的主要治療原則是抗感染，靜脈滴注抗生素，局部可用複方硼砂溶液漱口，也可含服有抗菌作用的喉片，同時注意休息、多飲水、進食流汁飲食。急性扁桃體炎反複發作，可發展為慢性扁桃體炎，其原因與免疫力低下有一定關係。
慢性扁桃體炎扁桃體中儲存有致病細菌，細菌分泌的毒素不但進入血液和炎性分泌物被吞下刺激胃腸道，可引起長期低熱、消化不良、食欲減退，當機體免疫力下降時又可急性發作，同時細菌和毒素可導致機體發生變態反應，引起風濕熱(風濕性關節炎和風濕性心髒病)、腎炎等疾病。慢性扁桃體炎的治療可采取綜合性措施，包括增強體質和免疫力，充分徹底的抗感染治療，中醫中藥治療，扁桃體局部衝洗。
