潰瘍性結腸炎可以使用柳氮磺胺嘧啶、美沙拉嗪栓等藥物治療，另外注意飲食，不要吃辛辣刺激性食物，不要喝酒，避免勞累。
治療潰瘍性直腸炎的常見方法
1、中藥理氣舒腸方治療：應以健脾補腎、益氣除濕為治本之法，清熱解毒，活血化瘀為治標之用，辨證施治，最忌長期應用大苦大寒之劑，亦可配合中藥針如麥注參麥注射液、黃芪注射液等靜滴以扶正。
2、程氏三伏貼治療：通過藥物直接貼敷刺激穴位，透過皮膚吸收，局部藥物濃度明顯高於其他部位，作用直接，對許多頑疾都有意想不到的顯著功效。
3、西藥治療：根據患者具體情況，如炎症明顯時可短期使用抗生素，配合口服麗珠腸樂、得舒特等藥物調節腸道功能。
4、中西藥結合灌腸.
5、心理治療：該病患者常有焦慮、憂鬱、緊張、多疑等精神心理改變，嚴重者可予抗抑鬱治療。
6、其它治療：
①營養飲食治療：可予高營養、低脂、少渣易消化飲食，或囑患者可予山藥、白扁豆、苡米等煮粥，常食健脾養胃;
②高壓氧治療：對治療潰瘍性直腸炎患者療效尢佳。
7、調理：病人應適當休息，進清淡、少渣、營養豐富、無刺激性的食物，並做到心情愉快，勞逸結合。
8、局部治療：直腸黏膜水腫者，可用生理鹽水、0.5-1%鞣酸、1:5000高錳酸鉀溶液灌洗直腸。黏膜糜爛者，可塗以2%醋酸可的鬆溶液或10%硝酸銀溶液。括約肌、肛提肌痙攣者，可將溫橄欖油注入直腸內。直腸黏膜萎縮變幹者，可每晚於直腸內注入0.5%薄荷油適量。臨床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黃黴液50-100毫升，隔一天交替保留灌腸，每天2次，有很好的療效。
