人類睡眠有其固有的機製，自然醒則是符合人體生物鍾規律的。光線是自然醒的必要條件，是人體內的生物鬧鍾。清晨，人體感受到逐漸強烈的太陽光線，褪黑素分泌就會減少，血清素分泌則增加，新陳代謝加快，人就逐漸從熟睡過渡到淺睡直到醒來。
快節奏的現代生活，使很多上班一族無法享受閑適的睡眠與自然蘇醒，於是鬧鍾便成了無奈的選擇。但據實驗研究表明，自然醒來與被鬧鍾叫醒所產生的生理和心理效應是很不同的。
從睡眠狀態過渡到清醒狀態時，人的呼吸會從16次/分鍾提高到24次/分鍾，心跳加快10次/分鍾，腦電波從8次/秒提高到30次/秒。如果突 然被鬧鍾叫醒，將使人產生心慌、情緒低落、感覺沒睡醒和懸空等不適感。如果是從深度睡眠中被突然叫醒，那麼，人的短期記憶能力、認知能力，甚至是計算技能 都會受到顯著影響;這些能力最多為正常狀態的65%，故被鬧鍾叫醒則與醉酒者相當。
常被鬧鍾叫醒還會損害健康。鬧鍾突如其來的響鬧會引起身體保護性的條件反射，提高體內腎上腺素水平。這種狀態如果持續數天、數周、數月，將導致高血壓、睡眠問題和精神壓抑。
這是因為睡眠過程中，人體會發生一些變化，使人更容易在早上發病，鬧鈴會加劇這個過程。
