肝門靜脈是由腸係膜上靜脈和脾靜脈在胰頭後方彙合而成。肝門靜脈由胰頭後方向右上方走行,經過肝十二指腸韌帶向肝門方向走行。到肝門附近分成左支和右支,經肝門入肝,注入到肝血竇。
肝門靜脈的屬支(流入到肝門靜脈的靜脈血管)除了腸係膜上靜脈和脾靜脈以外,還有胃左靜脈、腸係膜下靜脈、胃右靜脈、膽囊靜脈、附臍靜脈。
肝門靜脈內沒有有效的靜脈瓣,血液可以逆流,當肝門靜脈內壓力增高時(如肝硬化等引起),血液經過與肝門靜脈相連的食管靜脈叢、臍周靜脈網、直腸靜脈叢、腹膜後靜脈網或椎靜脈叢等,流到上腔靜脈或下腔靜脈,形成代償性側支循環。
肝門靜脈起始於腹腔內不成對器官的毛細血管,最後又終止於肝內毛細血管(即肝血竇),是兩套毛細血管之間的靜脈,是收集腹腔內不成對器官(食管腹段、胃、小腸、大腸、直腸上部、脾、膽囊、胰等)的血液注入肝髒的功能性血管。